R语言 RNAither包 ZScorePlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ZScorePlot(RNAither)
ZScorePlot()所属R语言包：RNAither

                                         Plot normalized intensity values per well
                                         每口井的图归强度值

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots the normalized intensity values for each well, together with a black line showing the mean, two green lines showing the standard deviation, and two red lines showing 2 standard deviations.
每口井的图归强度值，连同一个黑色的平均线，绿线显示标准偏差，和两个红色线条显示2个标准差。


用法----------Usage----------


ZScorePlot(header, dataset, flag, col4plot, col4anno, plotTitle, showPlot)



参数----------Arguments----------

参数：header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile  
数据集文件头生成的以generateDatasetFile


参数：dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile  
R的数据框生成的以generateDatasetFile


参数：flag
either 1 or 2. 1 if the dataset contains values per well, 2 if the dataset contains summarized values for each siRNA (e.g. a dataset summarized with summarizeReps).  
1或2。 1，如果数据集包含值每口井，2如果数据集包含每个siRNA的汇总值（如数据集总结与summarizeReps）。


参数：col4plot
a character string specifying the column whose values will be used for the plot  
一个字符串，指定列的值将被用于为图


参数：col4anno
a character string specifying the column that will be used for the plot annotation  
一个字符串，指定将图注释中使用的列


参数：plotTitle
the plot title  
图标题


参数：showPlot
  0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows.  
0或1。 1将在一个或几个小区的R GUI窗口打开，0只保存不打开窗户图（S）。


值----------Value----------

Plots the normalized intensity values for each well, together with a black line showing the mean, and two red lines showing 2 standard deviations. Clicking on the points shows the gene/siRNA name.
每口井的图归强度值，连同一个黑色的平均线，和两个红色线条显示2个标准差。上点一下，显示基因/ siRNA的名称。

The plot is saved as a pdf and a png file named after the experiment name specified in the header concatenated with the plotTitle.
图保存为PDF和PNG文件后的头在plotTitle串联指定的实验名称命名。

The function returns the plot name.
该函数返回小区名称。


参见----------See Also----------

plotBar, ZScorePlotTwo
plotBar，ZScorePlotTwo


举例----------Examples----------


data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")

normedvals <- ZScore(header, dataset, list("SigIntensity", 1))
ZScorePlot(normedvals[[1]], normedvals[[2]], 1, "SigIntensity", "GeneName",
"Normed intensity values per well", 1)

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