R语言 RNAither包 summarizeReps()函数中文帮助文档(中英文对照)

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summarizeReps(RNAither)
summarizeReps()所属R语言包：RNAither

                                         Generate a new dataset with summarized replicates
                                         总结复制生成新的数据集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generates a new dataset with summarized replicates.
总结复制生成一个新的数据集。


用法----------Usage----------


summarizeReps(data, funSum, col4val, col4anno, cols2del)



参数----------Arguments----------

参数：data
an R data frame generated with generateDatasetFile  
R的数据框生成的以generateDatasetFile


参数：funSum
a function used to summarize the values of a replicate, e.g.  mean,  median, rms, trim,  max,  min, closestToZero, furthestFromZero, ...  
总结复制值的功能，例如：  mean， median，rms，trim， max， min，closestToZero，furthestFromZero.. 。


参数：col4val
a character vector (containing for example  "SigIntensity",  Background,  NbCells,  PercCells, ...) specifying the columns that will be summarized by  funSum  
一个字符向量指定将 "SigIntensity"的总结列（包含例如 Background， NbCells， PercCells， funSum，...）


参数：col4anno
a character string specifying the name of the dataset column to be used to define the replicate, e.g.  "GeneName" or  "Internal_GeneID"  
一个字符串指定的被用来定义复制数据集列的名称，如 "GeneName"或 "Internal_GeneID"


参数：cols2del
a character vector containing the columns to delete, for example  "SDSIntensity"  
一个字符向量包含的列删除，例如 "SDSIntensity"


Details

详情----------Details----------

All columns containing replicate values will be summarized by  funSum. For all columns containing positions, screen numbers, plate numbers, etc., all information for different replicates will be kept, comma-separated. All columns containing standard deviations of channels should be specified in  colnames2delete.
所有列包含重复值将总结 funSum。重复为所有列包含位置，屏幕号码，车牌号码等，所有不同的信息将被保留，以逗号分隔。所有列载标准偏差通道应指定在 colnames2delete。


值----------Value----------

Returns the summarized dataset.
返回汇总数据集。


参见----------See Also----------

summarizeRepsNoFiltering, eraseDataSetColumn, generateReplicateMat, generateRepMatNoFilter, mean, median, rms, trim, max, min, closestToZero, furthestFromZero
summarizeRepsNoFiltering，eraseDataSetColumn，generateReplicateMat，generateRepMatNoFilter，mean，median，rms，trim，max，min，closestToZero，furthestFromZero


举例----------Examples----------


data(exampleDataset, package="RNAither")

colname4val <- c("SigIntensity", "Background", "NbCells", "PercCells")
summarizeddataset <- summarizeReps(dataset, mean, colname4val, "GeneName", "SDSIntensity")

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