plotQQperplate(RNAither)
plotQQperplate()所属R语言包:RNAither
Make a QQ plot per plate
使每盘的QQ图
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Shows and saves a QQ plot of the data for each experiment and each plate in the dataset.
显示并节省了DataSet中的每个板块和每个实验数据的QQ图。
用法----------Usage----------
plotQQperplate(header, dataset, channel, plotTitle, plotDesign, showPlot)
参数----------Arguments----------
参数:header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile
数据集文件头生成的以generateDatasetFile
参数:dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile
R的数据框生成的以generateDatasetFile
参数:channel
a character string specifying the name of the column containing the values to be plotted, e.g. "SigIntensity"
一个字符串,指定包含值的列名要绘制,例如: "SigIntensity"
参数:plotTitle
the plot title
图标题
参数:plotDesign
1 or 2. 1 will generate one window containing all plots, 2 will generate a series of plots.
1或2。 1,将生成一个窗口,其中包含的所有图,将产生一系列图。
参数:showPlot
0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows.
0或1。 1将在一个或几个小区的R GUI窗口打开,0只保存不打开窗户图(S)。
值----------Value----------
Saves the QQ plots in a pdf and a png file named after the experiment name specified in the header concatenated with the plotTitle.
保存在PDF和PNG文件后的头在 plotTitle串联指定的实验名称命名的QQ图。
The function returns a list containing:
该函数返回一个列表,其中包含:
参数:histoName
the plotname
在plotname
参数:c(minOfScreens, numOfScreens)
a vector with the number of the first experiment and of the last experiment
与第一实验的数量和向量的最后一个实验
参数:c(minOfPlates, numOfPlates)
a vector with the number of the first plate and the number of the last plate
与第一板的数量和向量的最后一个板块的数量
参见----------See Also----------
plotQQ, plotQQperscreen
plotQQ,plotQQperscreen
举例----------Examples----------
data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")
plotQQperplate(header, dataset, "SigIntensity", "QQplot", 1, 1)
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