R语言 RNAither包 percCellQualControl()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

percCellQualControl(RNAither)
percCellQualControl()所属R语言包：RNAither

                                         Quality control of the percentage of cells
                                         质量控制单元的百分比

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots a histogram of the percentage of cells per well (ratio of the number of identified cells and the number of identified objects) and allows the user to set an upper and a lower threshold so as to exclude wells from the analysis.
绘制直方图每口井的单元比例（确定单元的数量和比例确定对象的数量），并允许用户设置一个上限和下限阈值，以便从分析中排除井。


用法----------Usage----------


percCellQualControl(DataSetFile, nbLinesHeader, plotTitle)



参数----------Arguments----------

参数：DataSetFile
a dataset file generated with generateDatasetFile  
数据集文件生成的以generateDatasetFile


参数：nbLinesHeader
typically 3  
通常为3


参数：plotTitle
the plot title  
图标题


值----------Value----------

Prints out the list of wells under and over the predefined thresholds in the shell.
打印出井名单，并且在外壳的预定义阈值。

Saves a list of discarded siRNA values (if applicable) in a text file named after the experiment name specified in the header concatenated with either "percCellQualControl\_discarded\_higher.txt" or "percCellQualControl\_discarded\_lower.txt".
保存在一个废弃的siRNA值列表后要么串联头中指定的实验名称命名的文本文件（如果适用）“percCellQualControl \ _discarded \ _higher.txt”或“percCellQualControl \ _discarded \ _lower.txt”。

Saves the histogram with the applied thresholds in a pdf file named after the experiment name specified in the header concatenated with the  plotTitle.
保存后的头在 plotTitle串联指定的实验名称命名的PDF文件中的应用阈值的直方图。

Overwrites the given  DataSetFile with the new dataset.
覆盖给定的 DataSetFile新的数据集。


参见----------See Also----------

numCellQualControl
numCellQualControl


举例----------Examples----------


data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")
saveDataset(header, dataset, "save_testfile1.txt")

percCellQualControl("save_testfile1.txt", 3, "Histogram of the number of cells")

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