MannWhitney(RNAither)
MannWhitney()所属R语言包:RNAither
Perform a Mann-Whitney test
执行Mann-Whitney检验
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Performs the non-parametric Mann-Whitney test on the intensity data.
执行上的强度数据的非参数Mann-Whitney检验。
用法----------Usage----------
MannWhitney(dataset, listofargs)
参数----------Arguments----------
参数:dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile
R的数据框生成的以generateDatasetFile
参数:listofargs
a list containing: - "g" (greater) for significant increase, "l" (lower) for significant decrease, or "two.sided" for both - either a number indicating the true value of the mean, or a character string indicating the name of the gene to compare with - a character string specifying the column whose values will be used for the test - a character string specifying the name of the dataset column to be used to define the replicate, e.g. "GeneName" or "Internal_GeneID"
一个列表,其中包含: - "g"显着增加(更大),"l"(下)显着下降,或"two.sided"两个 - 一个数字表示真值的平均值,或一个字符串,表明该基因的名称比较 - 一个字符串,指定列的值将被用于测试 - 一个字符串,指定被用来定义复制数据集的列的名称,如 "GeneName"或 "Internal_GeneID"
值----------Value----------
Returns a list containing:
返回一个列表,其中包含:
参数:pValVec
a named vector of p-values
命名为向量的p-值
参数:dataset
the dataset with an added column "p.value.mannwhitney"
增值列 "p.value.mannwhitney"集
参数:paste(<code>"pValue.mannwhitney"</code>, testType, sep="_")
the character string "p.value.mannwhitney" concatenated with the testType (first element of listofargs)
字符串“p.value.mannwhitney的”与连接的testType(listofargs的第一个元素)
参数:"Mann-Whitney test"
the character string "Mann-Whitney test"
字符串“Mann-Whitney检验”
参见----------See Also----------
Ttest, RankProduct
Ttest,RankProduct
举例----------Examples----------
data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")
pvals1 <- MannWhitney(dataset, list("l", median(dataset$SigIntensity, na.rm=TRUE),
"SigIntensity", "GeneName"))
pValVec1 <- pvals1[[1]]
scoredDataset1 <- pvals1[[2]]
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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