makeBoxplot4PlateType(RNAither)
makeBoxplot4PlateType()所属R语言包:RNAither
Generate a boxplot of the data per plate
产生每盘数据的盒形图
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Generates a boxplot comparing the same plates in different experiments.
生成一个盒形图,比较不同实验相同的板。
用法----------Usage----------
makeBoxplot4PlateType(header, dataset, channel, plotTitle, showPlot)
参数----------Arguments----------
参数:header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile
数据集文件头生成的以generateDatasetFile
参数:dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile
R的数据框生成的以generateDatasetFile
参数:channel
a character string specifying the column whose values will be used for the boxplot
一个字符串,指定列的值将被使用的盒形图
参数:plotTitle
the plot title
图标题
参数:showPlot
0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows.
0或1。 1将在一个或几个小区的R GUI窗口打开,0只保存不打开窗户图(S)。
值----------Value----------
For each plate type, a boxplot of intensity values per experiment will be saved as a pdf and a png file named after the experiment name specified in the header concatenated with the plotTitle and the number of the plate.
为每个板型,盒形图,每个实验的强度值将被保存为PDF和PNG文件后 plotTitle和车牌号码串连头中指定的实验名称命名。
The function returns a list containing:
该函数返回一个列表,其中包含:
参数:plotName
the plotname
在plotname
参数:minOfPlates
the number of the first experiment
第一实验
参数:numOfPlates
the number of the last experiment
最后的实验数
参见----------See Also----------
makeBoxplotControls, makeBoxplotControlsPerScreen, makeBoxplotControlsPerPlate, makeBoxplotPerPlate, makeBoxplotPerScreen
makeBoxplotControls,makeBoxplotControlsPerScreen,makeBoxplotControlsPerPlate,makeBoxplotPerPlate,makeBoxplotPerScreen
举例----------Examples----------
data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")
makeBoxplot4PlateType(header, dataset, "SigIntensity", "Data vs. Controls", 1)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|