controlDensityPerScreen(RNAither)
controlDensityPerScreen()所属R语言包:RNAither
Plotting the control density per experiment
绘制每个实验的控制密度
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plots the density of positive and negative controls (if applicable) for each experiment.
图密度每个实验的阳性和阴性对照(如适用)。
用法----------Usage----------
controlDensityPerScreen(header, dataset, channel, plotTitle, showPlot, supHisto)
参数----------Arguments----------
参数:header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile
数据集文件头生成的以generateDatasetFile
参数:dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile
R的数据框生成的以generateDatasetFile
参数:channel
a character string specifying the name of the column containing the values for computing the density, e.g. "SigIntensity"
密度计算指定字符串包含值的列的名称,例如: "SigIntensity"
参数:plotTitle
the plot title
图标题
参数:showPlot
0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows
0或1。 0 1会打开一个或几个在R GUI窗口图,将只保存不打开窗户图()
参数:supHisto
0 or 1. 1 will additionally superimpose a colour histogram of the values for the positive and negative controls. Otherwise choose 0.
0或1。 1将另外叠加的颜色直方图为阳性和阴性对照值。否则,选择0。
值----------Value----------
Generates a series of plots for each experiment, showing the density of positive and negative controls (if applicable). The plots are saved as pdf and png files named after the experiment name specified in the header concatenated with the plotTitle and the number of the experiment.
产生了一系列图,每个实验显示阳性和阴性对照(如适用)的密度。图保存为PDF和 plotTitle和实验串连头中指定的实验名称命名的PNG文件。
The function returns a list of length 3 containing:
该函数返回一个长度为3个含有名单:
参数:plotName
the plotname
在plotname
参数:minOfScreens
the number of the first experiment
第一实验
参数:numOfScreens
the number of the last experiment
最后的实验数
参见----------See Also----------
controlDensity, controlDensityPerPlate
controlDensity,controlDensityPerPlate
举例----------Examples----------
data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")
controlDensityPerScreen(header, dataset, "SigIntensity", "Control density", 1, 1)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|