R语言 RNAither包 controlDensityPerPlate()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

controlDensityPerPlate(RNAither)
controlDensityPerPlate()所属R语言包：RNAither

                                         Plotting the control density per plate
                                         绘制控制密度每盘

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots the density of positive and negative controls (if applicable) for each plate.
图密度阳性和阴性对照（如适用），每块板。


用法----------Usage----------


controlDensityPerPlate(header, dataset, channel, plotTitle, plotDesign, showPlot, supHisto)



参数----------Arguments----------

参数：header
the header of a dataset file generated with generateDatasetFile  
数据集文件头生成的以generateDatasetFile


参数：dataset
an R data frame generated with generateDatasetFile  
R的数据框生成的以generateDatasetFile


参数：channel
a character string specifying the name of the column containing the values for computing the density, e.g. "SigIntensity"  
密度计算指定字符串包含值的列的名称，例如： "SigIntensity"


参数：plotTitle
the plot title  
图标题


参数：plotDesign
1 or 2. 1 will generate one window containing all plots, 2 will generate a series of plots  
1或2。 1将生成一个窗口，其中包含所有的图，会产生一系列图


参数：showPlot
0 or 1. 1 will open one or several plot windows in the R GUI, 0 will only save the plot(s) without opening windows  
0或1。 0 1会打开一个或几个在R GUI窗口图，将只保存不打开窗户图（）


参数：supHisto
0 or 1. 1 will additionally superimpose a colour histogram of the values for the positive and negative controls. Otherwise choose 0.
0或1。 1将另外叠加的颜色直方图为阳性和阴性对照值。否则，选择0。


值----------Value----------

Generates a series of plots for each experiment and each plate, showing the density of positive and negative controls (if applicable). The plots are saved as pdf and png files named after the experiment name specified in the header concatenated with the  plotTitle.
产生了一系列图，每个实验和每盘呈现阳性和阴性对照（如适用）的密度。图被保存为PDF和PNG文件后的头在 plotTitle串联指定的实验名称命名。

The function returns a list of length 3 containing:
该函数返回一个长度为3个含有名单：


参数：plotName
the plot name  
小区名称


参数：c(minOfScreens, numOfScreens)
a vector with the number of the first experiment and of the last experiment  
与第一实验的数量和向量的最后一个实验


参数：c(minOfPlates, numOfPlates)
a vector with the number of the first plate and the number of the last plate  
与第一板的数量和向量的最后一个板块的数量


参见----------See Also----------

controlDensity, controlDensityPerScreen
controlDensity，controlDensityPerScreen


举例----------Examples----------


data(exampleHeader, package="RNAither")
data(exampleDataset, package="RNAither")

controlDensityPerPlate(header, dataset, "SigIntensity", "Control density", 1, 1, 1)

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