compareHits(RNAither)
compareHits()所属R语言包:RNAither
Searching for common hits between different scoring methods
寻找不同的评分方法之间的共同命中
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Searches for common hits between different scoring methods.
不同的评分方法之间的共同点击搜索。
用法----------Usage----------
compareHits(hitVec1, hitVec2, namesHitVec1, namesHitVec2)
参数----------Arguments----------
参数:hitVec1, hitVec2
the two binary hit vectors to be compared
要比较两个二进制命中向量
参数:namesHitVec1, namesHitVec2
the names of the siRNAs corresponding to the hit vectors
命中向量相应的siRNA的名字
值----------Value----------
Returns a character vector indicating which siRNAs are identified as hits in two different hit scoring schemes.
返回一个特征向量,指示命中两个不同的命中得分计划确定其中的siRNAs。
参见----------See Also----------
vennDiag , Ttest, MannWhitney
vennDiag,Ttest,MannWhitney
举例----------Examples----------
data(scoredDataset1, package="RNAither")
data(pValVec1, package="RNAither")
data(scoredDataset2, package="RNAither")
data(pValVec2, package="RNAither")
##for details on the generation of pValVec and scoredDataset,[#一代pValVec和scoredDataset,]
##see the examples of the functions Ttest and MannWhitney linked above.[#TTEST和MannWhitney上面链接的功能的例子。]
scoredHits1 <- hitselectionPval(scoredDataset1, pValVec1, "SigIntensity", "Hits1", 0.05,
"GeneName", "pvalue_testfile1.txt")
scoredHits2 <- hitselectionPval(scoredDataset2, pValVec2, "SigIntensity", "Hits2", 0.05,
"GeneName", "pvalue_testfile2.txt")
hitVector1 <- scoredHits1[[2]]
hitVector2 <- scoredHits2[[2]]
common_hits <- compareHits(hitVector1, hitVector2, names(hitVector1), names(hitVector2))
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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