createRNAinteractFromFiles(RNAinteract)
createRNAinteractFromFiles()所属R语言包:RNAinteract
create an RNAinteract object from text files
创建一个文本文件RNAinteract的对象
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Reads text files with annotation, query and template design, and data. Creates a RNAinteract object.
读取文本文件,注释,查询和模板设计和数据。创建一个RNAinteract对象。
用法----------Usage----------
createRNAinteractFromFiles(name = "anonymous",
filePlatelist = "Platelist.txt",
fileReagents = "Reagents.txt",
fileTargets = "Targets.txt",
fileTemplateDesign = "TemplateDesign.txt",
fileQueryDesign = "QueryDesign.txt",
path = ".",
pdim = NULL,
Transformation = "log2")
参数----------Arguments----------
参数:name
A name for the screen.
屏幕名称。
参数:filePlatelist
The filename of the text file containing the plate list.
包含板列表的文本文件的文件名。
参数:fileReagents
The filename of the text file containing the reagent annotation.
文件名文本包含试剂注释的文件的。
参数:fileTargets
The filename of the text file containing the target annotation.
包含目标注释文本文件的文件名。
参数:fileTemplateDesign
The filename of the text file containing the template design.
包含模板设计文本文件的文件名。
参数:fileQueryDesign
The filename of the text file containing the query design.
文件名的文本文件包含的查询设计。
参数:path
The system directory were the textfiles filePlatelist, fileReagents, fileTargets, fileTemplateDesign, and fileQueryDesign are located.
系统目录下的文本文件filePlatelist,fileReagents,fileTargets,fileTemplateDesign,fileQueryDesign所在。
参数:pdim
The dimensions of the multi-well plates (e.g. pdim = c(nrow=24,ncol=16)). if pdim =NULL (default), the plate dimension will be estimated from the input data.
多孔板的尺寸(如pdim = c(nrow=24,ncol=16))。如果pdim =NULL(默认),板尺寸将会从输入数据的估计。
参数:Transformation
The transformation that is applied to the data. All calculations are done on additive scale.
被应用到数据的转变。所有计算都做添加剂的规模。
Details
详情----------Details----------
See vignette("RNAinteract") for an example how to create an RNAinteract object.
看到一个例子如何创建一个RNAinteract对象的小插曲(的“RNAinteract”)。
值----------Value----------
An object of class RNAinteract.
对象类RNAinteract。
作者(S)----------Author(s)----------
Bernd Fischer
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
RNAinteract-package, createRNAinteract, createCellHTSFromFiles
RNAinteract-package,createRNAinteract,createCellHTSFromFiles
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