create_Thetafile(RLMM)
create_Thetafile()所属R语言包:RLMM
Calculating Parameter Estimates
计算参数估计
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Assuming that the *.norm files are created, this step of the data analysis will calculate estimates of theta A and theta B values for each SNP and chip based on normalized probe intensity data from the *.norm files. The theta values are produced from fitting a probe-level additive model to the log2 A probe intensities and the B intensities separately.
假设创建*。规范文件,这一步的数据分析,将计算每个SNP与上归探针*强度数据为基础的芯片theta的A和THETA B值的估计。规范文件。 theta的值是从装修探针级添加剂模型探针强度和B强度的log2分开。
用法----------Usage----------
create_Thetafile(probefiledir = getwd(),
start = 1,
end = -1,
thetafile = "")
参数----------Arguments----------
参数:probefiledir
Character string specifying the directory with the *.norm files (optional)
字符串*指定的目录。规范文件(可选)
参数:start
An integer value specifying which SNP number we should start at when calculating the theta values (optional)
一个整数,指定SNP的数量,我们应该开始计算THETA值(可选)
参数:end
An integer value specifying which SNP number we should stop at when calculating the theta values (optional)
一个整数,指定SNP的数量,我们应该停止在计算theta的值(可选)
参数:thetafile
A character string specifying the name the theta file will be saved as (optional)
一个字符串指定名称theta的文件将被保存(可选)
作者(S)----------Author(s)----------
Nusrat Rabbee <nrabbee@post.harvard.edu>, Gary Wong
<wongg62@gmail.com>
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|