R语言 rGADEM包 gadem-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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gadem-class(rGADEM)
gadem-class()所属R语言包：rGADEM

                                        Class "gadem"
                                         类“gadem”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This object contains all gadem output information.
此对象包含所有gadem输出信息。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("gadem", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("gadem", ...)。


插槽----------Slots----------




motifList List of input PWM.
输入PWM motifList名单。




parameters List of rGADEM parameters.
参数列表rGADEM参数。


方法----------Methods----------




[ signature(x = "gadem"): subset gadem object.
[signature(x = "gadem")：子集gadem对象。




[[] signature(x = "gadem"): subset gadem object.
[]signature(x = "gadem")：子集gadem对象。




nMotifs signature(x = "gadem"): Number of motifs identified
nMotifssignature(x = "gadem")：确定图案




names signature(x = "gadem"): Assign motifs names.
名signature(x = "gadem")：指定图案的名称。




dim signature(x = "gadem"): Number of sequences identified for each motifs.
朦胧signature(x = "gadem")：确定每个图案的序列号。




consensus signature(x = "gadem"):Sequence of consensus motifs.
共识signature(x = "gadem")：序列共识图案。




nOccurrences signature(x = "gadem"):View of PWMs.
nOccurrencessignature(x = "gadem")：观的PWM。




startPos signature(x = "gadem"):Start position for each sequences.
startPossignature(x = "gadem")：开始为每个序列的位置。




endPos signature(x = "gadem"):End position for each sequences.
endpos的signature(x = "gadem")：每个序列的结束位置。




getPWM signature(x = "gadem"):End position for each sequences.
getPWMsignature(x = "gadem")：每个序列的结束位置。


作者（S）----------Author(s)----------


Arnaud Droit <a href="mailto:arnaud.droit@crchuq.ulaval.ca">arnaud.droit@crchuq.ulaval.ca</a>



参见----------See Also----------

motif , align, parameters
motif，align，parameters


举例----------Examples----------


showClass("gadem")

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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