R语言 ReQON包 ReadPosErrorPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ReadPosErrorPlot(ReQON)
ReadPosErrorPlot()所属R语言包：ReQON

                                        Plot distribution of errors by read position.
                                         图分布读取位置错误。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots the number of sequencing errors by read position.
图编号测序错误的读取位置。


用法----------Usage----------


ReadPosErrorPlot(ReadPosErrors, error_col = "blue", thresh = 1.5,
   thresh_col = "cyan", xlabel = "Read Position", ylabel = "# Errors",
   main_title = "Distribution of Errors by Read Position")



参数----------Arguments----------

参数：ReadPosErrors
vector of sequencing error counts by read position.
向量的测序错误计数读取位置。


参数：error_col
color of line plotting the errors counts. Default = "blue".
线的颜色绘制错误计数。默认=“蓝”。


参数：thresh
Threshold for identifying read positions with large numbers of errors, plotted as a horizontal dashed line. Threshold is set as “thresh * (average number of errors per read position)”. Default = 1.5.
阈值的确定与大量的错误的读取位置，水平虚线绘制。阈值设置为“阈值*（平均每读取位置的误差数）”。默认值= 1.5。


参数：thresh_col
color of threshold line. Default = "cyan".
颜色的临界线。默认=“青色”。


参数：xlabel
x-axis label. Default = "Read Position".
X轴标签。默认=“读取位置”。


参数：ylabel
y-axis label. Default = "# Errors".
Y轴标签。默认=“＃错误”。


参数：main_title
title.  Default = "Distribution of Errors by Read Position".
称号。默认=“读取位置错误”的分布。


Details

详情----------Details----------

ReadPosErrorPlot plots the distribution of sequencing errors by read position.  If the input vector is $ReadPosErrors from ReQON output, this function will create the top left diagnostic plot that is output from ReQON.
ReadPosErrorPlot图的测序错误的读取位置的分布。如果输入向量美元ReadPosErrors ReQON输出，此功能将创建左上角诊断图，是从ReQON输出。

For more details and interpretation, see the vignette by:  browseVignettes("ReQON").
对于更多的细节和解释，看到的小插曲：browseVignettes（“ReQON）。


作者（S）----------Author(s)----------


Christopher Cabanski <a href="mailto:cabanski@email.unc.edu">cabanski@email.unc.edu</a>



举例----------Examples----------


## Create data of error counts [＃创建数据错误计数]
x <- c( 1:30 )
err <- x^2 + ( 30 - x )^1.6 + rnorm(30, 0, 100)

## plot errors by read position[图＃读取位置错误]
ReadPosErrorPlot( err )

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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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