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R语言 Repitools包 genQC()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 12:50:37 | 显示全部楼层 |阅读模式
genQC(Repitools)
genQC()所属R语言包:Repitools

                                        Plot Quality Checking Information for Sequencing Data
                                         测序数据的图质量检查信息

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A series of quality control plots for sequencing data are made.
测序数据的质量控制图系列。


用法----------Usage----------


  ## S4 method for signature 'character'
genQC(qc.data, ...)
  ## S4 method for signature 'SequenceQCSet'
genQC(qc.data, expt = "Experiment")



参数----------Arguments----------

参数:qc.data
A vector of character strings, each containing an absolute path to an RData file of a SequenceQC object, or a SequenceQC set object.
一个字符串,每个包含一个绝对路径SequenceQC对象,或SequenceQC集对象的RDATA文件的向量。


参数:expt
The names of the experiments which the lanes are about.
实验车道约的名字。


参数:...
The expt argument, which is not directly used in the character method.
expt的说法,这是不能直接在character方法使用。


Details

详情----------Details----------

qc.data can be named, in which case this gives the names of the lanes used in the plotting. Otherwise the lanes will be given the names "Lane 1", "Lane 2", ..., "Lane n".
qc.data可以被命名,在这种情况下,这使在绘图中使用的车道名称。否则车道将被给予的名字"Lane 1","Lane 2","Lane n"。


值----------Value----------

The function is called for its output. The output is multiple pages, so the pdf device should be called before this function is.
其输出函数被调用。输出是多个页面,所以此功能之前,应该被称为PDF设备。


作者(S)----------Author(s)----------


Dario Strbenac



参考文献----------References----------



举例----------Examples----------


  ## Not run: [#无法运行:]
    qc.files <- list.files(qc.dir, "QC.*RData", full.names = TRUE)
    genQC(qc.files, "My Simple Experiment")
  
## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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