enrichmentPlot(Repitools)
enrichmentPlot()所属R语言包：Repitools
Plot the distribution of sequencing enrichment.
绘制分布测序富集。
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function to generate a plot of the distribution of sequencing reads enrichments.
功能产生测序分布的图读取富集。
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'GRangesList'
enrichmentPlot(x, seq.len, cols = rainbow(length(x)),
xlim = c(0, 20), main = "Enrichment Plot", total.lib.size = TRUE, verbose = TRUE, ...)
参数----------Arguments----------
参数：x
A GRangesList object of reads to plot enrichment of. The chromosome lengths must be stored in the Seqinfo of this object.
一个GRangesList对象读取绘制富集的。染色体的长度必须存储在此对象的Seqinfo。
参数：seq.len
The fragment size to be used for extending the sequencing reads.
读取延长测序的片段大小。
参数：cols
The line colour for each element of x
每的x元素的线条颜色
参数：xlim
xlim parameter passed to plot, the default is appropriate for "linear" cpgDensityCalc weighting.
xlim参数传递到plot，默认情况下是适当的"linear"cpgDensityCalc比重。
参数：main
main parameter passed to plot
main参数传递plot的
参数：total.lib.size
Whether to normalise enrichment values to the total number of reads per lane.
是否标准化富集值的总数，每个通道读取。
参数：verbose
Print details of processing.
打印处理的细节。
参数：...
Additional graphical parameters to pass to plot.
额外的图形参数传递plot。
Details
详情----------Details----------
See enrichmentCalc for details of how the results are determined.
看到enrichmentCalc如何确定结果的详细信息。
值----------Value----------
A plot is created. The data processed by enrichmentCalc is invisibly returned.
创建一个图。 enrichmentCalc处理的数据无形返回。
作者（S）----------Author(s)----------
Aaron Statham
举例----------Examples----------
data(samplesList) # GRangesList of reads 'samples.list.subset'[GRangesList的写着“samples.list.subset”]
enrichmentPlot(samples.list.subset, seq.len = 300, total.lib.size = FALSE)
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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-26 12:49:17
