R语言 Repitools包 ClusteredScoresList()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

ClusteredScoresList(Repitools)
ClusteredScoresList()所属R语言包：Repitools

                                        Container for coverage matrices with clustering results.
                                         聚类结果的覆盖矩阵的容器。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Contains a list of coverage matrices, the parameters that were used to generate them origin, and also cluster membership and expression data.
包含了一个覆盖矩阵，参数被用来生成它们的起源，也是聚类成员和表达数据的列表。

It also allows the user to take the ScoresList output of featureScores, and do their own custom clustering on the coverage matrices, then save the clustering results in this container.
它也允许用户ScoresListfeatureScores输出，并做自己的自定义覆盖矩阵聚类，然后将其保存在这个容器中的聚类结果。


构造----------Constructor----------

ClusteredScoresList(x, anno = x@anno, scores = tables(x),           expr = NULL, expr.name = NULL,           cluster.id, sort.name = NULL, sort.data = NULL) Creates a ClusteredScoresList object.
ClusteredScoresList(x, anno = x@anno, scores = tables(x),           expr = NULL, expr.name = NULL,           cluster.id, sort.name = NULL, sort.data = NULL)建立ClusteredScoresList的对象。




x A ScoresList object.
x一ScoresList对象。




anno A GRanges object. Give this value
anno一GRanges对象。给这个值




scores A list of coverage matrices. Give this if the matrices
scores一个覆盖矩阵列表。给这个矩阵




expr A numeric vector, same length as number of
expr一个数字向量，长度相同数




expr.name A label, describing the expression data.
expr.name一个标签，说明表达数据。




cluster.id A vector, same length as number of
cluster.id一个向量，长度相同数




sort.data Vector of data to order features
sort.data矢量数据责令功能




sort.name Human readable description of what
sort.name人类可读的描述是什么


子集----------Subsetting----------

In the following code snippets, x is a ClusteredScoresList object.
在下面的代码片段，x是ClusteredScoresList的对象。

x[i] Creates a ClusteredScoresList object, keeping only the i matrices.
x[i]建立ClusteredScoresList的对象，保持只i矩阵。

subsetRows(x, i = NULL) Creates a ClusteredScoresList object, keeping only the i features.
subsetRows(x, i = NULL)建立ClusteredScoresList的对象，使只有i功能。

clusters(x) Creates a ClusteredScoresList object, keeping only the i features.
clusters(x)建立ClusteredScoresList的对象，使只有i功能。


存取----------Accessors----------

In the following code snippets, x is a ClusteredScoresList object.
在下面的代码片段，x是ClusteredScoresList的对象。

clusters(x) Get the cluster ID of each feature.
clusters(x)获取每个功能的聚类ID。


作者（S）----------Author(s)----------


Dario Strbenac

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。