R语言 Repitools包 annoDF2GR()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

annoDF2GR(Repitools)
annoDF2GR()所属R语言包：Repitools

                                        Convert a data.frame to a GRanges.
                                         转换到一个农庄的数据框。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Checks that the data.frame has the required columns, chr, start, end, then creates a GRanges, keeping all of the additional columns.
，检查data.frame有所需的列，chr，start，end，然后创建一个GRanges，保持所有其他列。


用法----------Usage----------


  ## S4 method for signature 'data.frame'
annoDF2GR(anno)



参数----------Arguments----------

参数：anno
An data.frame, describing some genomic features.
的data.frame，说明一些基因的功能。


Details

详情----------Details----------

Extra columns are added to the elementMetadata of the GRanges object.
额外的列被添加到elementMetadataGRanges对象。


值----------Value----------

A GRanges of the annotation.
一个GRanges注解。


作者（S）----------Author(s)----------


Dario Strbenac



举例----------Examples----------


  df <- data.frame(chr = c("chr1", "chr3", "chr7", "chr22"),
                   start = seq(1000, 4000, 1000),
                   end = seq(1500, 4500, 1000),
                   t = c(3.11, 0.93, 2.28, -0.18),
                   gc = c("High", "High", "Low", "High"))

  annoDF2GR(df)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。