R语言 REDseq包 example.assignedREDseq()函数中文帮助文档(中英文对照)

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example.assignedREDseq(REDseq)
example.assignedREDseq()所属R语言包：REDseq

                                         an example assigned REDseq dataset
                                         一个例子分配REDseq集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

an example assigned REDseq dataset generated from assignSeq2REsite
例如分配REDseq集从assignSeq2REsite产生


用法----------Usage----------


data(example.assignedREDseq)



格式----------Format----------

The format is: List of 3<br> $ passed.filter   :'data.frame': Sequences that passed the filters:<br> ..$ SEQid   :Sequence ID <br> ..$ REid    : Restriction Enzyme Site ID <br> ..$ Chr     : Chromosome <br> ..$ strand  : Strand <br> ..$ SEQstart: Sequence Start <br> ..$ SEQend  : Sequence End <br> ..$ REstart : Restriction Enzyme Site Start <br> ..$ REend   : Restriction Enzyme Site End <br> ..$ Distance: Distance from SEQstart to REstart <br> ..$ Weight  : Weighted count for this REid and this SEQid <br> $ notpassed.filter:'data.frame' : Sequences that did not pass the filters <br> ..$ SEQid   :Sequence ID <br> ..$ REid    : Restriction Enzyme Site ID <br> ..$ Chr     : Chromosome <br> ..$ strand  : Strand <br> ..$ SEQstart: Sequence Start <br> ..$ SEQend  : Sequence End <br> ..$ REstart : Restriction Enzyme Site Start <br> ..$ REend   : Restriction Enzyme Site End <br> ..$ Distance: Distance from SEQstart to REstart <br> ..$ Weight  : Weighted count for this REid and this SEQid <br> $ mREwithDetail   :'data.frame': Detailed information about the sequences that are associated with multiple REid - for debugging: <br> ..$ SEQid   :Sequence ID <br> ..$ REid    : Restriction Enzyme Site ID <br> ..$ Chr     : Chromosome <br> ..$ strand  : Strand <br> ..$ SEQstart: Sequence Start <br> ..$ SEQend  : Sequence End <br> ..$ REstart : Restriction Enzyme Site Start <br> ..$ REend   : Restriction Enzyme Site End <br> ..$ Distance: Distance from SEQstart to REstart <br> ..$ Weight  : Weighted count for this REid and this SEQid <br> ..$ count   : count of seed for this REid and SEQid <br> ..$ total.count: total number of seeds that are associated with this SEQid <br>
格式是：参考$ 3 passed.filter名单：“数据框”：通过过滤器的序列：参考.. $ SEQid：序列编号参考.. $里德：酶切位点ID < BR> .. $染色体：染色体参考.. $链：东街参考.. $ SEQstart：顺序开始参考.. $ SEQend：序列结束参考.. $重启：酶切位点开始< BR> .. $ REend：酶切位点结束参考.. $距离：从SEQstart的距离重新启动参考..重量：此里德这SEQid参考美元notpassed.filter的加权数：数据框“：未通过过滤器参考.. $ SEQid：序列编号参考.. $里德：酶切位点编号参考.. $染色体：染色体参考.. $链的序列：钢绞线参考.. $ SEQstart：顺序开始参考.. $ SEQend：序列结束参考.. $重启：酶切位点开始参考.. $ REend：酶切位点结束参考......距离：距离从SEQstart重新启动参考..重量：加权计数，里德和本SEQid参考$ mREwithDetail：“数据框”：有关多个里德序列的详细信息 - 调试：参考.. $ SEQid：序列编号参考.. $里德：酶切位点的ID参考..美元染色体：染色体参考.. $链：钢绞线参考.. $ SEQstart：序列启动参考.. $ SEQend：序列结束参考.. $重新启动：酶切位点开始参考.. $ REend：酶切位点结束参考.. $距离：从SEQstart距离重新启动<BR > ..重量：里德和这个SEQid参考.. $计数加权计数：这里德和SEQid的参考计数种子.. $ total.count：种子的总数，这个SEQid参考


举例----------Examples----------


data(example.assignedREDseq)
## maybe str(example.assignedREDseq) ; plot(example.assignedREDseq) ...[＃也许STR（example.assignedREDseq）;图（example.assignedREDseq）...]

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