distanceHistSeq2RE(REDseq)
distanceHistSeq2RE()所属R语言包:REDseq
Plot the distance distribution from sequence to the associated RE sites
绘制距离分布序列相关的稀土网站
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Give an overview of the distance distribution from all assigned sequences to the associated RE sites. If average or estimate is used for assigning sequences to RE sites, the count for histogram drawing will be adjusted with the weight assigned.
给所有分配序列的距离分布的概述到相关RE网站。如果平均或预算的分配序列重新站点,直方图绘制的罪名将调整与分配的重量。
用法----------Usage----------
distanceHistSeq2RE(assignedSeqs, longestDist = 1000,
title = "histogram of distance to assigned RE site",
xlab = "Distance to assigned RE site", ylab = "Frequency", ylim="")
参数----------Arguments----------
参数:assignedSeqs
result returned from assignSeq2REsite
返回结果从assignSeq2REsite
参数:longestDist
longest distance to keep in the plot
最长的距离保持在积
参数:title
an overall title for the plot
图的总冠军
参数:xlab
a title for the x axis
X轴的标题
参数:ylab
a title for the y axis
为Y轴的标题
参数:ylim
range of y to be plotted
y的范围要绘制
作者(S)----------Author(s)----------
Lihua Julie Zhu
参见----------See Also----------
assignSeq2REsite, distanceHistSeq2RE
assignSeq2REsite,distanceHistSeq2RE
举例----------Examples----------
data(example.assignedREDseq)
distanceHistSeq2RE(example.assignedREDseq,ylim=c(0,20))
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注:
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