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R语言 RedeR包 relax()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 12:40:21 | 显示全部楼层 |阅读模式
relax(RedeR)
relax()所属R语言包:RedeR

                                        relax
                                         放松

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function starts the dynamic layout and sets the force-directed options available in RedeR app.
此功能启动的动态布局和设置力瑞德应用程序的可用选项。


用法----------Usage----------


relax(obj,p1=100,p2=100,p3=100,p4=100,p5=100,p6=100,p7=10,p8=10,ps=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数:obj
Object of RedPort Class.  
对象的RedPort类。


参数:p1
Edge target length (in pixels; >= 1 ) <numeric>.  
边缘目标长度(以像素为单位;> = 1)<numeric>。


参数:p2
Edge stiffness (arbitrary unities; >= 1 ) <numeric>.  
任意统一边缘刚度(> = 1)<numeric>。


参数:p3
Node repel factor (arbitrary unities; >= 1 ) <numeric>.  
节点排斥的因素(武断统一;> = 1)<numeric>。


参数:p4
Node perimeter effect (in pixels; >= 1 ) <numeric>.  
节点周边的影响(以像素为单位;> = 1)<numeric>。


参数:p5
Node speed limit (arbitrary unities; >= 1 ) <numeric>.  
节点限速(武断统一;> = 1)<numeric>。


参数:p6
Nest-nest edge target length, i.e., edge target between linked containers (in pixels; >= 1 ) <numeric>.  
巢窝边的目标长度,即目标之间联系的容器边缘(以像素为单位;> = 1)<numeric>。


参数:p7
Nest-node repel factor, i.e., repulsion among containers and out-nodes (arbitrary unities; >= 1 ) <numeric>.   
巢节点排斥的因素,即容器和出节点之间的斥力(任意统一;> = 1)<numeric>。


参数:p8
Repulsion radius, i.e., this parameter limits the repel factor range (given in p1 unites; >= 1 ) <numeric>.   
排斥半径,也就是说,这个参数限制,排斥的因素范围(在P1给予团结;> = 1)<numeric>。


参数:ps
Panel settings: logical value, whether to start interactive panel.  
面板设置:逻辑值,是否要启动交互式面板。


Details

详情----------Details----------

One of the most versatile features of RedeR is the ability to deal with nested network objects using dynamic simulation, which makes it possible to represent, for example, subnetworks and time-series onto the same graph in a user-friendly routine. The simulation uses force-directed algorithms as described elsewhere (Brandes 2001; Fruchterman and Reingold 1991). Here we adapted the method to deal with nested networks. In force-directed graphs, each edge can be regarded as a spring - with a given target length - and can either exert a repulsive or attractive force on the connected nodes, while nodes are analogous to mutually repulsive charged particles that move according to the applied forces. In RedeR, the simulation is additionally constrained by the hierarchical structure. For example, a nested node is constrained to its parent-node by opposing forces applied by the nest, which is regarded as a special node whose nested objects can reach a local equilibrium independently from other network levels. The simulation is adjusted by global options and evolves iteratively (and interactively) until the system reaches the equilibrium state. The parameters controlling the dynamics are arbitrarily set to layout sparse networks with a few nodes (e.g. 10-100 nodes). For large and dense networks better results can be achieved interactively by tuning one or more parameters.
瑞德最多才多艺的特点之一是能够处理嵌套的网络使用动态模拟的对象,这使得它能够代表,例如,子网和时间序列上相同的图形中的一个用户友好的例行。模拟使用力导向其他地方所描述的算法(2001年布兰德斯; 1991年Fruchterman和莱因戈尔德)。在这里,我们调整的方法来处理嵌套的网络。在部队向图,每个边可以被视为一个春天 - 一个给定的目标长度 - 可以对所连接的节点上的排斥或吸引力,而节点是相互排斥的带电粒子移动根据应用类似力量。在瑞德,模拟加限制的层次结构。例如,一个嵌套的节点被限制在它的父节点反对巢,这是作为一个特殊的节点,嵌套对象,可以从其他网络水平达到当地平衡独立作用力。模拟全局选项调整和迭代演进(交互),直到系统达到平衡状态。动态控制参数任意设置稀疏的网络布局,有几个节点(如10-100节点)。对于大型和密集的网络,可以达到更好的效果,通过调整一个或多个参数的交互。


作者(S)----------Author(s)----------


Mauro Castro



参考文献----------References----------




举例----------Examples----------



rdp <- RedPort('MyPort')

g <- graph.lattice(c(5,5,5))

## Not run: [#无法运行:]

  calld(rdp)
  addGraph( rdp, g, layout.random(g) )
  relax(rdp)


## End(Not run) [#结束(不运行)]



转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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