revish(reb)
revish()所属R语言包：reb
Creation of CGH (reverse in situ hybridization) style character strings
全息创作风格（扭转原位杂交）字符串
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function returns a two lists of character strings. These two lists correspond to the enhanced and diminished chromosomal bands.
此函数返回字符串的两个名单。这两个列表对应的增强和减弱的染色体带。
用法----------Usage----------
revish(cset, genome, chr, organism = NULL)
参数----------Arguments----------
参数：cset
expression set containing cytogenetic predictions, see reb
含有单元遗传学预测表达式设置，看到reb
参数：genome
chromLocation object containing annotation information
chromLocation对象包含注释信息
参数：chr
chromosome to examine
染色体检查
参数：organism
if NULL, determination of the host organism will be retrieved from the organism slot of the chromLocation object. Otherwise "h", "r", or "m" can be used to specify human, rat, or mouse chromosome information
如果为NULL，宿主生物体的决心，将取自organism的chromLocation对象插槽。否则"h"，"r"或"m"可以用来指定人类，大鼠，小鼠染色体信息
值----------Value----------
参数：enh
list of enhanced bands on each individual sample
加强对每个样品带列表
参数：dim
list of diminished bands on each individual sample
减少每个样品带列表
作者（S）----------Author(s)----------
Karl J. Dykema, <a href="mailto:karl.dykema@vai.org">karl.dykema@vai.org</a>
Kyle A. Furge, <a href="mailto:kyle.furge@vai.org">kyle.furge@vai.org</a>
参考文献----------References----------
genomic hybridization with gene expression-based regional expression biases to identify genetic abnormalities in hepatocellular carcinoma. BMC Genomics. 2005 May 9;6(1):67. PMID: 1588246
参见----------See Also----------
reb
reb
举例----------Examples----------
data(idiogramExample)
ix <- abs(colo.eset) > .225
colo.eset[ix] <- NA
idiogram(colo.eset,ucsf.chr,"14",method="i",dlim=c(-1,1),col=.rwb)
revlist<- revish(colo.eset,ucsf.chr,"14")
str(revlist)
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发表于 2012-2-26 12:31:24
