getMolecule(Rdisop)
getMolecule()所属R语言包:Rdisop
Calculate mass and isotope information for a molecule given as sum formula
计算求和公式的分子质量和同位素信息
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Parse the sum formula and calculate the theoretical exact mass and the isotope distribution.
解析求和公式和计算理论的精确质量和同位素分布。
用法----------Usage----------
getMolecule(formula, elements = NULL, z = 0, maxisotopes = 10)
getMass(molecule)
getFormula(molecule)
getIsotope(molecule, index)
getScore(molecule)
getValid(molecule)
参数----------Arguments----------
参数:formula
Sum formula
求和公式
参数:elements
list of allowed chemical elements, defaults to full periodic system of elements
允许的化学元素的列表,默认为全元素周期系
参数:z
charge z of molecule for exact mass calculation
确切的分子质量计算收取ž
参数:maxisotopes
maximum number of isotopes shown in the resulting molecules
同位素在分子显示的最大数量
参数:molecule
an initialized molecule as returned by getMolecule() or the decomposeMass() and decomposeIsotope() functions
初始化分子getMolecule()或的decomposeMass()和decomposeIsotope()函数返回
参数:index
return the n-th isotope mass/abundance pair of the molecule
返回第n同位素的分子质量/丰双
Details
详情----------Details----------
getMolecule() Parse the sum formula and calculate the theoretical exact monoisotopic mass and the isotope distribution. For a given element, return the different mass values.
getMolecule()解析求和公式和计算理论的精确单一同位素质谱和同位素分布。对于一个给定的元素,返回不同的质量值。
值----------Value----------
getMolecule: A list with the elements
getMolecule:一个元素的列表
参数:formula
repeated sum formula
反复求和公式
参数:mass
exact monoisotopic mass of molecule
确切的单一同位素分子质量
参数:score
probability, for given molecules a dummy value which is always 1.0
概率,给定分子的一个空值总是1.0
参数:valid
result of neutrogen rule check
neutrogen规则检查结果
参数:isotopes
a list of isotopes
同位素的列表
getMass, getFormula and getScore: return the mass of the
getMass,getFormula和getScore:返回的质量
作者(S)----------Author(s)----------
Steffen Neumann <sneumann@IPB-Halle.DE>
参考文献----------References----------
WABI Paper
举例----------Examples----------
# For Ethanol:[乙醇:]
getMolecule("C2H6O")
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