R语言 RCytoscape包 setNodeAttributesDirect()函数中文帮助文档(中英文对照)

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setNodeAttributesDirect(RCytoscape)
setNodeAttributesDirect()所属R语言包：RCytoscape

                                        setNodeAttributesDirect
                                         setNodeAttributesDirect

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Transfer the named node attribute, for all named nodes, to Cytoscape. The attribute must be previously defined on the nodes of the graph:  see nodeDataDefaults in the graph class.  This method is useful if you wish to run a 'movie.'  For example, if you have a timecourse experiment, with different values at successive time points  of the 'lfc' (log fold change) measurements or 'pValue' of each node.  With a nodeColor and nodeSize rule already specified, you can animate the display of the nodes across time in the graph by pumping new values of the attributes attributes using this method, and then asking for a redraw.  An example of such node-attribute-driven animation can be found here....[todo].
转让命名的节点属性，命名为所有节点，Cytoscape的。属性必须先前定义图形的节点上：看到图中的类nodeDataDefaults。这种方法是有用的，如果你想运行的“电影”。例如，如果你有一个“LFC（log倍）测量或pValue每个节点的连续时间点的不同的价值观，timecourse实验。随着nodeColor和已指定nodeSize的规则，你可以动画显示图中的跨时间节点抽水属性的新值属性使用这种方法，然后要求重绘。例如，可以在这里找到一个这样的节点属性驱动的动画...... [待办事项]。


用法----------Usage----------


setNodeAttributesDirect(obj, attribute.name, attribute.type, node.names, values)



参数----------Arguments----------

参数：obj
a CytoscapeWindowClass object.  
CytoscapeWindowClass对象。


参数：attribute.name
a string one of the attributes defined on the nodes.  
string节点上定义的属性之一。


参数：attribute.type
a string from one of these three groups: (floating, numeric, double), (integer, int), (string, char, character).  This parameter is required because RCytoscape cannot always infer the type of an attribute.
string这三组：（浮动，数字，双），（整数，INT），（字符串，字符，字符）。此参数是必需，因为RCytoscape不能总是推断属性的类型。


参数：node.names
a list of strings, node names
list字符串，节点名称


参数：values
a list of objects of the type specified by 'attribute.name', one per node
的由“attribute.name指定的类型的对象，每一个节点列表


值----------Value----------

None.
没有。


作者（S）----------Author(s)----------


Paul Shannon



参见----------See Also----------

setNodeAttributes setEdgeAttributes setEdgeAttributesDirect
setNodeAttributes setEdgeAttributes setEdgeAttributesDirect


举例----------Examples----------


  cw <- new.CytoscapeWindow ('setNodeAttributesDirect.test', graph=makeSimpleGraph())
  stopifnot ('count' %in% noa.names (cw@graph))
  result = setNodeAttributesDirect (cw, 'count', 'int', c ('A', 'B', 'C'), c (4, 8, 12))

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