setEdgeSourceArrowColorDirect(RCytoscape)
setEdgeSourceArrowColorDirect()所属R语言包:RCytoscape
setEdgeSourceArrowColorDirect
setEdgeSourceArrowColorDirect
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
In the specified CytoscapeWindow, set the edgeSourceArrowColor of the specified edge or edges. Low numbers, near zero, are transparent. High numbers, near 255, are maximally opaque: they are fully visible.
在指定CytoscapeWindow,设置指定edgeSourceArrowColor边缘或边缘。数字低,接近于零,是透明的。高的数字,在255附近,是最大限度地不透明:他们是完全可见。
用法----------Usage----------
setEdgeSourceArrowColorDirect(obj, edge.names, new.colors)
参数----------Arguments----------
参数:obj
a CytoscapeWindowClass object.
CytoscapeWindowClass对象。
参数:edge.names
one or more String objects, edges in standard Cytoscape form.
一个或多个String对象,边在标准Cytoscape的形式。
参数:new.colors
one or more String object, representing a color in a '#RRGGBB' hex format.
一个或多个String对象,代表在一个#RRGGBB十六进制格式的颜色。
值----------Value----------
None.
没有。
作者(S)----------Author(s)----------
Paul Shannon
参见----------See Also----------
setNodeEdgeSourceArrowColorDirect
setNodeEdgeSourceArrowColorDirect
举例----------Examples----------
cw <- new.CytoscapeWindow ('setEdgeSourceArrowColorDirect.test', graph=makeSimpleGraph())
displayGraph (cw)
redraw (cw)
layout (cw, 'jgraph-spring')
arrows = c ('Arrow', 'Diamond', 'Circle')
edgeType.values <- c ('phosphorylates', 'synthetic lethal', 'undefined')
setEdgeSourceArrowRule (cw, 'edgeType', edgeType.values, arrows)
setEdgeTargetArrowRule (cw, 'edgeType', edgeType.values, arrows)
colors.1 = c ("#FFFFFF", "#FFFFFF", "#FFFFFF")[FFFFFF“或者”#FFFFFF的“,”#FFFFFF“)]
colors.2 = c ("#AA00AA", "#00AAAA", "#0000AA")[AA00AA“,#00AAAA”,“#0000AA”)]
edge.names = as.character (cy2.edge.names (cw@graph)) [1:3]
for (i in 1:2) {
setEdgeSourceArrowColorDirect (cw, edge.names, colors.1)
redraw (cw)
Sys.sleep (1)
setEdgeSourceArrowColorDirect (cw, edge.names, colors.2)
redraw (cw)
Sys.sleep (1)
} # for i[因为我]
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