R语言 rama包 weight.plot()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

weight.plot(rama)
weight.plot()所属R语言包：rama

                                        Plot the weights of a given array using the spatial location of
                                         使用的空间位置，画出一个给定的数组中的权重

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot the weights of a given array using the spatial location of the genes on the slide.This function is a useful diagnostic tool.
画出一个给定的阵列使用基因上slide.This功能的空间位置的权重是一个有用的诊断工具。


用法----------Usage----------


weight.plot(mcmc.obj,coordinate,array=1)



参数----------Arguments----------

参数：mcmc.obj
An object of class mcmc as returned by fit.model
一个类的对象mcmcfit.model返回的


参数：coordinate
The coordinate of each gene on the corresponding array. The coordinates should be a two column integer valued matrix containing the row indices (column 1) and the column indices (column 2). The row indices should all be distinct. All indices should start at zero!  
相应的阵列上的每一个基因的坐标。坐标应该是一个两列的整数价值矩阵包含行指数（1列）和列索引（2列）。行指标都应该是不同的。所有指标应该从零开始！


参数：array
An integer corresponding to the array number to be plotted.
要绘制相应的整数数组号码。


值----------Value----------

The image plot of the weights. A small weight (bright color) correspond to an outlier.
形象权的图。一个小，重量轻（颜色鲜艳）对应一个离群。


作者（S）----------Author(s)----------


Raphael Gottardo



参考文献----------References----------

Raphael Gottardo, Adrian E. Raftery, Ka Yee Yeung, and Roger Bumgarner

参见----------See Also----------

arrange.row
arrange.row


举例----------Examples----------


data(hiv)
### Initialize the proposals[＃初始化提案的]
mcmc.hiv<-fit.model(hiv[1:640,c(1:4)],hiv[1:640,c(5:8)],B=1000,min.iter=500,batch=1,shift=30,mcmc.obj=NULL,dye.swap=TRUE,nb.col1=2)
weight.plot(mcmc.hiv,hiv[1:640,9:10],array=3)

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