gcPerPosition(R453Plus1Toolbox)
gcPerPosition()所属R语言包:R453Plus1Toolbox
GC-Content Per Position
每个位置的GC含量
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function plots the GC-content frequency per base position.
此功能图的GC含量的频率,每个碱基的地位。
用法----------Usage----------
gcPerPosition(object, range=0.95, type="l", col="blue", xlab="Position", ylab="Frequency", ...)
参数----------Arguments----------
参数:object
An object of class DNAStringSet, ShortRead or SFFContainer.
对象类DNAStringSet,ShortRead或SFFContainer。
参数:range
An integer vector of length one or two. If length one only bases up to the percent quantile of read lengths defined by the given value are shown. A vector of length two gives the start and end base between which the GC-content is plotted.
一个或两个长度的整数向量。如果长度只有一个碱基了%分位数的定义给定值的读长。一个长度为2的向量,给碱基之间的GC含量绘制的开始和结束。
参数:type
The type of the plot (see "plot").
该图的类型(见“图”)。
参数:col
The plotting color.
绘制的颜色。
参数:xlab
The X axis label.
X轴的标签。
参数:ylab
The Y axis label.
Y轴的标签。
参数:...
Arguments to be passed to methods, such as graphical parameters (see "par").
参数被传递到方法,如图形参数(见“面值”)。
作者(S)----------Author(s)----------
Christian Ruckert
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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