complexity.dust(R453Plus1Toolbox)
complexity.dust()所属R语言包：R453Plus1Toolbox
Sequence Complexity Using The DUST Algorithm
序列的复杂性，使用防尘算法
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function evaluates the sequence complexity using the DUST algorithm.
此函数计算序列的复杂性，使用防尘算法。
用法----------Usage----------
complexity.dust(object, xlab="Complexity score (0=high, 100=low)", ylab="Number of sequences",
xlim=c(0, 100), col="firebrick1", breaks=100, ...)
参数----------Arguments----------
参数：object
An object of class DNAStringSet, ShortRead or SFFContainer.
对象类DNAStringSet，ShortRead或SFFContainer。
参数：xlab
The X axis label.
X轴的标签。
参数：ylab
The Y axis label.
Y轴的标签。
参数：xlim
The limits of the X axis.
X轴的限制。
参数：col
The plotting color.
绘制的颜色。
参数：breaks
The number of breaks in the histogram (see "hist").
的在直方图截断数（见“历史”）。
参数：...
Arguments to be passed to methods, such as graphical parameters (see "par").
参数被传递到方法，如图形参数（见“面值”）。
Details
详情----------Details----------
The complexity score is based on how often different trinucleotides occur and is scaled between 0 and 100. A sequence of homopolymer repeats (e.g. TTTTTTTTTT) has a score of 100, of dinucleotide repeats (e.g. TATATATATA) has a score around 49, and of trinucleotide repeats (e.g. TAGTAGTAG) has a score around 32. Scores above seven can be considered low-complexity.
往往是不同的三核苷酸发生的复杂性得分是基于0和100之间缩放。均聚物重复序列（如TTTTTTTTTT）的核苷酸重复的得分为100，（如TATATATATA）大约有49的比分，三核苷酸重复（如TAGTAGTAG）大约有32得分。上述七个分数可以考虑低复杂度。
值----------Value----------
A numeric vector containing the complexity score for each sequence.
一个数字的向量，为每个序列的复杂性得分。
作者（S）----------Author(s)----------
Christian Ruckert
参考文献----------References----------
Bioinformatics, 2011 Mar 15;27(6):863-4.
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-26 11:48:45
