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R语言 R453Plus1Toolbox包 baseFrequency()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 11:48:02 | 显示全部楼层 |阅读模式
baseFrequency(R453Plus1Toolbox)
baseFrequency()所属R语言包:R453Plus1Toolbox

                                        Absolute And Relative Frequency Of The Four Bases.
                                         四大碱基的绝对值和相对值的频率。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function returns the absolute and the relative frequency of the four bases (A, C, G, T).
这个函数返回的四个碱基(一,C,G,T),绝对和相对频率。


用法----------Usage----------


  baseFrequency(object)



参数----------Arguments----------

参数:object
An object of class DNAStringSet, ShortRead or SFFContainer.  
对象类DNAStringSet,ShortRead或SFFContainer。


Details

详情----------Details----------

This function makes use of the alphabetFrequency function from package  Biostrings.
此功能使包Biostrings使用的alphabetFrequency功能。


值----------Value----------

A data.frame with two columns containing the absolute and relative frequencies  respectively and six rows, one for each of the four bases (A, C, G, T), one for other symbols  contained in the reads and one summarizing the five aforementioned rows.
与两列总结上述五个行包含的绝对和相对的频率分别为六行,每四个碱基(A,C,G,T),在读中的其他符号和一个数据框。


作者(S)----------Author(s)----------



Christian Ruckert


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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