plotInteractionsPerChromosome(r3Cseq)
plotInteractionsPerChromosome()所属R语言包:r3Cseq
Plot interaction regions per each chromosome of interest
每利益的每个染色体的图互动区域
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plot the distribution of interaction regions per each interested input chromosome
每人每个感兴趣的输入染色体绘制的互动区域分布
用法----------Usage----------
plotInteractionsPerChromosome(object, chromosomeName)
参数----------Arguments----------
参数:object
r3Cseq object. The object is the container of interaction regions produced by getInteractions function.
r3Cseq对象。对象是getInteractions功能所产生的相互作用区的容器。
参数:chromosomeName
Character. The input chromosome name (e.g. "chr1")
字符。输入染色体的名称(如“chr1”)
值----------Value----------
Plots interaction regions per chromosome on the active graphical device.
图相互作用区域每个染色体上活跃的图形设备。
作者(S)----------Author(s)----------
S. Thongjuea
参见----------See Also----------
plotInteractionsNearViewpoint, plotOverviewInteractions, plot3Cecdf
plotInteractionsNearViewpoint,plotOverviewInteractions,plot3Cecdf
举例----------Examples----------
####Create the r3Cseq object#############[###创建r3Cseq对象#############]
library(BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9)
load(system.file("data","example.data.rda",package="r3Cseq"))
calculateRPM(my.data)
getInteractions(my.data)
####Plot[###图]
plotInteractionsPerChromosome(my.data,"chr10")
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