R语言 r3Cseq包 getViewpoint()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getViewpoint(r3Cseq)
getViewpoint()所属R语言包：r3Cseq

                                        get the viewpoint of 3C-seq data
                                         3C-seq的数据得到的观点

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The viewpoint is the region of interest, which can be a promoter region of an interested gene,  an enhancer, and a transcrition factor binding region. The genomic region, which show the highest number of reads per restriction fragment, represents the viewpoint.
的观点是该区域的利益，它可以是一个感兴趣的基因，一个增强，和transcrition因子结合区域的子区域。基因组区域，这表明最高读取每限制性片段的数量，代表的观点。


用法----------Usage----------


getViewpoint(object)



参数----------Arguments----------

参数：object
r3Cseq object, the object is the container of interaction regions produced by getInteractions function.  
r3Cseq对象，该对象是容器getInteractions功能所产生的相互作用区。


值----------Value----------

The viewpoint shows in the IRanges
观点显示在IRanges的


作者（S）----------Author(s)----------



S. Thongjuea




参见----------See Also----------

getCoverage, getReadCountPerRestrictionFragment, calculateRPM
getCoverage，getReadCountPerRestrictionFragment，calculateRPM


举例----------Examples----------


       
####Create the r3Cseq object#############[＃＃＃创建r3Cseq对象＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃]
        library(BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9)
    load(system.file("data","example.data.rda",package="r3Cseq"))
        calculateRPM(my.data)
        viewpoint<-getViewpoint(my.data)
        viewpoint
       

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。