calculateRPM(r3Cseq)
calculateRPM()所属R语言包:r3Cseq
calculate read per million (RPM)
计算每百万阅读(转)
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Normalize 3C-seq data by transforming raw reads to read per million per each restriction fragment
通过改变原料标准化3C-seq的数据读取到每个限制性片段每读每百万
用法----------Usage----------
calculateRPM(object)
参数----------Arguments----------
参数:object
r3Cseq object. The object might contain the raw read generated by function getReadCountPerRestrictionFragment
r3Cseq对象。对象可能包含原始读取功能getReadCountPerRestrictionFragment
作者(S)----------Author(s)----------
S. Thongjuea
参见----------See Also----------
getCoverage, getReadCountPerRestrictionFragment, contrRPM, expRPM
getCoverage,getReadCountPerRestrictionFragment,contrRPM,expRPM
举例----------Examples----------
####Create the r3Cseq object#############[###创建r3Cseq对象#############]
library(BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9)
load(system.file("data","example.data.rda",package="r3Cseq"))
calculateRPM(my.data)
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