drawSimpleChrom(quantsmooth)
drawSimpleChrom()所属R语言包:quantsmooth
Draw chromosome-like icons
绘制染色体一样的图标
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function paints chromosomal icons on an existing plot
此功能对现有的图描绘的染色体图标
用法----------Usage----------
drawSimpleChrom(x, y, len = 3, width = 1, fill, col, orientation = c("h", "v"), centromere.size = 0.6)
参数----------Arguments----------
参数:x
start x-position
启动X-位置
参数:y
start y-position
开始y位置
参数:len
total length of the chromosome
染色体的总长度
参数:width
width of the chromosome
染色体的宽度
参数:fill
character, {"a","p","q","q[1-3]","p[1-3]" }. Events to a chromosome can be depicted by coloring "a"ll of the chromosome, the complete p or q-arm, or a subsegment of the arms
字符,{“A”,“P”,“Q”,“Q [1-3]”,“P [1-3]”}。染色体的事件可以描绘着色“”LL染色体,全部P或Q-臂,或子段的武器
参数:col
color(s) of fill
颜色(S)fill的
参数:orientation
either "h"orizontal or "v"ertical
无论是“H”orizontal或“V”ertical
参数:centromere.size
The size of the centromere as fraction of the width
着丝粒宽的一小部分的大小
值----------Value----------
This function is executed for its side effects
这个函数执行它的副作用
作者(S)----------Author(s)----------
Jan Oosting
举例----------Examples----------
plot(c(0,4),c(0,3),type="n",xaxt="n",yaxt="n",xlab="",ylab="")
drawSimpleChrom(2,3,fill=c("p","q3"),col=c("red","blue"),orientation="v")
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注:
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