R语言 qrqc包 FASTQSummary-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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FASTQSummary-class(qrqc)
FASTQSummary-class()所属R语言包：qrqc

                                        FASTQSummary class representing the summaries of a FASTQ file
                                         代表一个FASTQ文件摘要FASTQSummary类

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This class contains the same slots as the SequenceSummary, as well as additional slots for quality information.
这个类包含了相同的SequenceSummary，质量信息以及附加插槽插槽。


插槽----------Slots----------

In addition to the slots inherited from SequenceSummary, FASTQSummary contains:
在除了SequenceSummary继承插槽，FASTQSummary包含：




quality a string indicating the type of quality (used to convert ASCII characters to quality
quality一个字符串表示的质量（用ASCII字符转换质量




qual.freqs a dataframe of quality frequencies by
qual.freqsdataframe质量频率




mean.qual a numeric that is the mean quality across all positions, weighted by the number of reads that extended to that
mean.qual数字是所有职位的平均质量，数量加权读取，扩展到了


作者（S）----------Author(s)----------


Vince Buffalo <vsbuffalo@ucdavis.edu>



参见----------See Also----------

FASTASummary is the counterpart of this class for FASTA data.
FASTASummary是这一类FASTA格式的数据的对应。

readSeqFile is the function that takes a FASTQ file and returns a FASTQSummary object.
readSeqFile的功能是，需要FASTQ文件并返回一个FASTQSummary对象。

plotBases is a function that plots the distribution of bases over sequence length for a particular FASTQSummary object. plotGC combines and plots the GC proportion.
plotBases是一个函数，碱基序列的长度超过特定FASTQSummary对象的分布图。 plotGC结合和图的GC比例。

plotQuals is a function that plots the distribution of qualities over sequence length for a particular FASTQSummary object.
plotQuals是一个功能绘出特定FASTQSummary对象分布序列的长度超过应具备的素质。

plotSeqLengths is a function that plots a histogram of sequence lengths for a particular FASTQSummary object.
plotSeqLengths是一个函数，绘制直方图序列的长度为特定FASTQSummary对象。


举例----------Examples----------


showClass("FASTQSummary")

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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