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R语言 qpgraph包 qpRndGraph()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 11:41:14 | 显示全部楼层 |阅读模式
qpRndGraph(qpgraph)
qpRndGraph()所属R语言包:qpgraph

                                         Undirected random d-regular graphs
                                         随机无向D-正则图

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Samples an undirected d-regular graph approximately uniformly at random.
样品无向D-正则图约在随机均匀。


用法----------Usage----------


qpRndGraph(p=6, d=2, R.code.only=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数:p
number of vertices.
顶点的数目。


参数:d
degree of every vertex.
每个顶点的程度。


参数:R.code.only
logical; if FALSE then the faster C implementation is used (default); if TRUE then only R code is executed.
逻辑;如果FALSE然后用C实现更快(默认);如果TRUE然后只R代码被执行。


Details

详情----------Details----------

This function implements the algorithm from Steger and Wormald (1999) for sampling undirected d-regular graphs from a probability distribution of all d-regular graphs on p vertices which is approximately uniform. More concretely, for all vertex degree values d that grow as a small power of p, all d-regular graphs on p vertices will have in the limit the same probability as p grows large. Steger and Wormald (1999, pg. 396) believe that for d >> sqrt(p) the resulting probability distribution will no longer be approximately uniform.
此功能实现从斯特格和沃莫尔德的(1999)取样从概率分布p个顶点上的所有D-正规的图形,这大约是统一的无向D-正则图的算法。更具体地说,所有顶点的度值d的增长作为一个小功率的p,p个顶点上的所有D-正则图,将有相同的概率为p增长大的限制。 Steger和沃莫尔德(1999年,396页)认为,D >> SQRT(P)的概率分布将不再是约均匀。

This function is provided in order to generate a random undirected graph as input to the function qpG2Sigma which samples a random covariance matrix whose inverse (aka, precision matrix) has zeroes on those cells corresponding to the missing edges in the input graph. d-regular graphs are useful for working with synthetic graphical models for two reasons: one is that d-regular graph density is a linear function of d and the other is that the minimum connectivity degree of two disconnected vertices is an upper bound of their outer connectivity (see Castelo and Roverato, 2006, pg. 2646).
此功能作为函数的输入,以生成一个随机的无向图qpG2Sigma样本随机协方差矩阵的逆(又名,精度矩阵),这些单元输入图中的边缺少相应的零。 D-正则图是有用的工作与合成图形模型的原因有两个:一个是,D-正则图的密度是D的线性函数,另一个是最低的两个断开的顶点连通度是其外层的上限连接(见卡斯特洛和Roverato,2006年,PG。2646)。


值----------Value----------

The adjacency matrix of the resulting graph.
结果图的邻接矩阵。


作者(S)----------Author(s)----------


R. Castelo and A. Roverato



参考文献----------References----------

Gaussian graphical model search from microarray data with p larger than n, J. Mach. Learn. Res., 7:2621-2650, 2006.
Combinatorics, Probab. and Comput., 8:377-396.

参见----------See Also----------

qpG2Sigma
qpG2Sigma


举例----------Examples----------


nVar <- 50  ## number of vertices[#数量的顶点]
maxCon <- 5 ## maximum connectivity per vertex[#最大连接每个顶点]

set.seed(123)

A <- qpRndGraph(p=nVar, d=maxCon)

summary(apply(A, 1, sum))

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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