R语言 puma包 plotHistTwoClasses()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotHistTwoClasses(puma)
plotHistTwoClasses()所属R语言包：puma

                                        Stacked histogram plot of two different classes
                                         两个不同的类叠加柱状图图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Stacked histogram plot of two different classes
两个不同的类叠加柱状图图


用法----------Usage----------


plotHistTwoClasses(
        scores
,        class1Elements
,        class2Elements
,        space=0
,        col=c("white", "grey40")
,        xlab="PPLR"
,        ylab="Number of genes"
,        ylim=NULL
,        las=0 # axis labels all perpendicular to axes
,        legend=c("non-spike-in genes", "spike-in genes")
,        inset=0.05
,        minScore=0
,        maxScore=1
,        numOfBars=20
,        main=NULL
)



参数----------Arguments----------

参数：scores
A numeric vector of scores (e.g. from the output of pumaDE)  
一个分数的数字向量（例如从pumaDE输出）


参数：class1Elements
Boolean vector, TRUE if element is in first class  
布尔向量，TRUE，如果元素是一流


参数：class2Elements
Boolean vector, TRUE if element is in second class  
布尔向量，TRUE，如果元素是在第二类


参数：space
Numeric. x-axis distance between bars  
数字。 x轴之间的距离条形


参数：col
Colours for the two different classes  
两个不同类的颜色


参数：xlab
Title for the x-axis  
x轴标题


参数：ylab
Title for the y-axis  
y轴标题


参数：ylim
2-element numeric vector showing minimum and maximum values for y-axis.  
2元的数字矢量显示为Y轴的最小值和最大值。


参数：las
See par. Default of 0 means axis labels all perpendicular to axes.  
看到par。默认值为0意味着轴标签的所有垂直轴。


参数：legend
2-element string vector giving text to appear in legend for the two classes.  
2元串向量使文字出现在传说中，这两个类。


参数：inset
See legend  
看到legend


参数：minScore
Numeric. Minimum score to plot.  
数字。图的最低分数。


参数：maxScore
Numeric. Maximum score to plot.  
数字。图的最高得分。


参数：numOfBars
Integer. Number of bars to plot.  
整数。图条形。


参数：main
String. Main title for the plot.  
字符串。图的主标题。


值----------Value----------

This function has no return value. The output is the plot created.
这个函数没有返回值。输出是创建的图。


作者（S）----------Author(s)----------


Richard D. Pearson



举例----------Examples----------


        class1 <- rnorm(1000,0.2,0.1)
        class2 <- rnorm(1000,0.6,0.2)
        class1[which(class1<0)] <- 0
        class1[which(class1>1)] <- 1
        class2[which(class2<0)] <- 0
        class2[which(class2>1)] <- 1
        scores <- c(class1, class2)
        class1elts <- c(rep(TRUE,1000), rep(FALSE,1000))
        class2elts <- c(rep(FALSE,1000), rep(TRUE,1000))
        plotHistTwoClasses(scores, class1elts, class2elts, ylim=c(0,300))

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