R语言 puma包 numTP()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

numTP(puma)
numTP()所属R语言包：puma

                                         Number of True Positives for a given proportion of False Positives.
                                         一定比例的误报真阳性数。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Often when evaluating a differential expression method, we are interested in how well a classifier performs for very small numbers of true positives. This method gives one way of calculating this, by determining the number of true positives for a set proportion of false positives.
经常评估差异表达方法时，我们有兴趣在如何以及分类为真阳性的非常小的数字执行。此方法提供了一种计算的方法，确定为真阳性数设置比例的误报。


用法----------Usage----------


numTP(scores, truthValues, FPRate = 0.5)



参数----------Arguments----------

参数：scores
A vector of scores. This could be, e.g. one of the columns of the statistics of a DEResult object.  
一个分数的向量。这可能是，例如：之一DEResult对象的统计列。


参数：truthValues
A boolean vector indicating which scores are True Positives.  
一个布尔向量表示哪些分数是真阳性。


参数：FPRate
A number between 0 and 1 identify the proportion of flase positives for which we wish to determine the number of true positives.  
0和1之间的数字确定的FLASE阳性，我们希望确定真阳性数的比例。


值----------Value----------

An integer giving the number of true positives.
一个整数，真阳性数。


作者（S）----------Author(s)----------


Richard D. Pearson



参见----------See Also----------

Related methods numFP, plotROC and calcAUC.
此方法numFP，plotROC和calcAUC。


举例----------Examples----------


class1a <- rnorm(1000,0.2,0.1)
class2a <- rnorm(1000,0.6,0.2)
class1b <- rnorm(1000,0.3,0.1)
class2b <- rnorm(1000,0.5,0.2)
scores_a <- c(class1a, class2a)
scores_b <- c(class1b, class2b)
classElts <- c(rep(FALSE,1000), rep(TRUE,1000))
print(numTP(scores_a, classElts))
print(numTP(scores_b, classElts))

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