R语言 PROMISE包 jung.rstat()函数中文帮助文档(中英文对照)

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jung.rstat(PROMISE)
jung.rstat()所属R语言包：PROMISE

                                        Function to Compute Jung's Statistics
                                         荣格的统计函数来计算

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Compute statistic that measures the correlation of many continuous variables with a censored time-to-event variable
计算统计，许多连续变量的相关性措施与审查的时间到事件的变量


用法----------Usage----------


jung.rstat(x, time.cens, strat = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：x
a data frame with row corresponding to probe set and column corresponding to subjects, the order of columns (subjects) should match the order of rows in time.cens.  
与行相应的数据框探针组和列相应的科目，列（学科）的顺序应符合为了在time.cens行。


参数：time.cens
a data frame with number of row equal to number of column in x. It contains two columns with first for time and second for censor (1 = event, 0 = censored).     
在x列数相等的行数与数据框。它包含两列，第一时间和第二次审查（1 =事件，0 =审查）。


参数：strat
a vector of stratum to calculate stratified r-type association statistics, default = NULL.  
一个阶层向量计算分层的R型协会的统计数据，默认值= NULL。


值----------Value----------

Returns a vector of Jun's r-type association statistics.
返回一个军的R型协会统计的向量。


注意----------Note----------

The order of subjects in x (column), time.cens, and strat should all match.  The original statistic proposed by Jung, Owzar, and George can be written as a dot-product.   The statistic returned by this routine is expressed in the form of a correlation statistic by dividing the dot product by the square root of the lengths of the two vectors in the numerator.
X（列），time.cens和战略的科目顺序都应该匹配。原荣，Owzar，乔治提出的统计，可以写一个点的产品。这个例程返回的统计数字是由分子中的两个向量的长度的平方根除以点产品的相关统计数据的形式表示。


作者（S）----------Author(s)----------



Stan Pounds <a href="mailto:stanley.pounds@stjude.org">stanley.pounds@stjude.org</a>; Xueyuan Cao <a href="mailto:xueyuan.cao@stjude.org">xueyuan.cao@stjude.org</a>




参考文献----------References----------

associate gene expression levels with survival. Stat Med 24:3077-88

参见----------See Also----------

PROMISE
PROMISE


举例----------Examples----------


## load sampExprSet.[＃加载sampExprSet。]
data(sampExprSet)

## extract expression matrix from sampExprSet[＃提取从sampExprSet表达矩阵]
Y <- exprs(sampExprSet)

## extract end point data from sampExprSet[＃从sampExprSet提取终点数据]
time.cens <-pData(phenoData(sampExprSet))[, 3:4]
strat <- pData(phenoData(sampExprSet))$strat

## compute Jung's r-type association statistics[＃计算荣格的R型协会的统计数据]
jungstat <- jung.rstat(Y, time.cens, strat = strat)

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