profile-methods(procoil)
profile-methods()所属R语言包:procoil
Retrieve prediction profile from a CCProfile object
检索从CCProfile对象预测个人资料
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function for retrieving the prediction profile from a
预测从配置文件检索功能
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'CCProfile'
profile(fitted)
参数----------Arguments----------
参数:fitted
the coiled coil prediction to be considered
要考虑的卷曲预测
Details
详情----------Details----------
The function profile provides an accessor function for retrieving the prediction profile from a CCProfile object without the need to directly access the profile slot.
功能profile提供一个无需直接访问CCProfile插槽检索profile对象的预测个人资料的存取功能。
值----------Value----------
profile returns a vector with the prediction profile.
profile返回一个向量与预测个人资料。
作者(S)----------Author(s)----------
Ulrich Bodenhofer <a href="mailto:bodenhofer@bioinf.jku.at">bodenhofer@bioinf.jku.at</a>
参考文献----------References----------
Hochreiter, S. (2011) Complex networks govern coiled coil oligomerization - predicting and profiling by means of a machine learning approach. Mol. Cell. Proteomics.
参见----------See Also----------
procoil,
procoil
举例----------Examples----------
## predict oligomerization of GCN4 wildtype[#预测因子GCN4野生齐聚]
GCN4wt<-predict(PrOCoilModel,
"MKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLV",
"abcdefgabcdefgabcdefgabcdefga")
## show raw prediction profile[#显示原预测的文件。]
profile(GCN4wt)
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