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R语言 PROcess包 bslnoff()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 11:28:05 | 显示全部楼层 |阅读模式
bslnoff(PROcess)
bslnoff()所属R语言包:PROcess

                                        Baseline Substraction
                                         基线减法

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function estimates the baseline and then removes baseline from the raw spectrum.
这个函数估计的基线,然后删除原始光谱的基线。


用法----------Usage----------


bslnoff(f, breaks = 200, qntl = 0, method = c("loess", "approx"), bw = 0.005, plot = FALSE, ...)



参数----------Arguments----------

参数:f
a matrix with M/Z values in the first column and intensities in the second column  
在第二列矩阵与m / z值在第一列和强度


参数:breaks
number of breaks set to M/Z values for finding the local minima or points below a centain quantile of intensities; breaks -1 equally spaced intervals on the log M/Z scale.  
数设置为m / z值低于强度centain的分量寻找局部极小点的截断截断-1等距间隔对log的M / Z比例。


参数:qntl
if 0, find local minima; if >0 find intensities < qntl*100th quantile locally.
如果为0,找到局部极小;如果> 0,局部强度<qntl * 100位数。


参数:method
"loess" or "approx" (linear interpolation).
“黄土”或“约”(线性插值)。


参数:bw
the bandwidth to be passed to loess.
带宽被传递到黄土。


参数:plot
TRUE or FALSE, if true, it will plot the raw spectrum, theestimated baseline and the baseline substracted spectrum.
TRUE或FALSE,如果属实,这将绘制的原始谱,theestimated的基线和基线谱中减去。


参数:...
Further parameters that get passed on to plot.
进一步获得通过绘图的参数。


值----------Value----------

a matrix of two columns: the first column being the M/Z values same as  the input, and the second column being the baseline substracted spectra.
矩阵的两列:第一列相同的M / Z值作为输入,第二列的基准光谱中减去。


作者(S)----------Author(s)----------


Xiaochun Li



举例----------Examples----------


fdat <- system.file("Test", package = "PROcess")
fs <- list.files(fdat, pattern="\\.*csv\\.*", full.names=TRUE)
f1 <- read.files(fs[1])
fcut <- f1[f1[,1]>0,]
bseoff <-bslnoff(fcut,method="loess",plot=TRUE, bw=0.1)
title(basename(fs[1]))

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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