PREDAResults2GenomicRegionsSingle(PREDA)
PREDAResults2GenomicRegionsSingle()所属R语言包:PREDA
identify significant genomic regions from a single analysis in a PREDAResults object
从一个单一的分析确定重大在PREDAResults对象的基因组区域
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
identify significant genomic regions from a single analysis in a PREDAResults object
从一个单一的分析确定重大在PREDAResults对象的基因组区域
用法----------Usage----------
# PREDAResults2GenomicRegionsSingle(.Object,
# qval.threshold=0.05, analysisName=NULL,
# use.referencePositions=TRUE, smoothStatistic.tail=NULL,
# smoothStatistic.threshold=NULL)
PREDAResults2GenomicRegionsSingle(.Object, ...)
参数----------Arguments----------
参数:.Object
Object of class PREDAResults or PREDADataAndResults
对象类PREDAResults或PREDADataAndResults
参数:...
See below
见下文
qval.threshold: q-value threshold used to identify significant genomic regions
qval.threshold:Q值阈值用于识别显着的基因组区域
analysisName: name of the analysis to be considered
analysisName:名称被视为分析
use.referencePositions: Logical, if TRUE the input reference positions used for PREDA analysis wil be used to identify significant genomic regions boundaries as well.
use.referencePositions:逻辑,如果真正用于普雷达分析WIL输入参考位置被用来确定以及显著的基因组区域的边界。
smoothStatistic.tail: Possible values are "upper" or "lower". This parameter specify if only one tail of the smoothed statististic distribution must be considered. If it is NULL, both tails are used and smoothStatistic.threshold is ignored.
smoothStatistic.tail:可能的值是“上”或“低”。此参数指定必须考虑,如果只有一个平滑statististic分布的尾部。如果它是空的,两个尾巴的使用和被忽略smoothStatistic.threshold。
smoothStatistic.threshold: Threshold on smoothStatistic values to select significant genomic regions.
smoothStatistic.threshold阈值:上smoothStatistic值的选择显着的基因组区域。
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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