R语言 PREDA包 GenomicRegionsAnnotate()函数中文帮助文档(中英文对照)

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GenomicRegionsAnnotate(PREDA)
GenomicRegionsAnnotate()所属R语言包：PREDA

                                         extract annotations from a GenomicAnnotations object for a set of regions specified as a GenomicRegions object
                                         一个区域作为GenomicRegions对象指定的一组提取从GenomicAnnotations对象的注释

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

extract annotations from a GenomicAnnotations object for a set of regions specified as a GenomicRegions object
一个区域作为GenomicRegions对象指定的一组提取从GenomicAnnotations对象的注释


用法----------Usage----------


# GenomicRegionsAnnotate(.Object1, .Object2,
# AnnotationsHeaders=NULL, sep.character="; ",
# complete.inclusion=FALSE, annotationAsRange=FALSE,
# getJustFeaturesNumber=FALSE)

GenomicRegionsAnnotate(.Object1, .Object2, ...)



参数----------Arguments----------

参数：.Object1
An object of class GenomicRegions  
一个类GenomicRegions的对象


参数：.Object2
An object of class GenomicAnnotations  
一个类GenomicAnnotations的对象


参数：...
See below     
见下文

AnnotationsHeaders: Names of optional annotations fields from GenomicAnnotations  object that are used to annotate the GenomicRegions object. Multiple annotation fields can be used   
AnnotationsHeaders：从GenomicAnnotations对象可选的注释字段用来注释GenomicRegions对象的名称。可以使用多个注释字段

sep.character: Character sequence used to separate annotation features   
sep.character：字符序列，用来分隔注解功能

complete.inclusion: Logical, if TRUE only annotations features entirely covered by  one of the genomic regions are considered. (e.g. a gene completely included in the genomic regions from start to end) If FALSE also partial overlapping annotation features are used   
complete.inclusion：逻辑，如果真正的唯一的注解功能完全覆盖的基因组区域之一，被认为是。 （例如，一个基因完全的基因组区域，包括从开始到结束），如果为FALSE也部分重叠注释功能

annotationAsRange: Logical, if TRUE only the first and last annotation features associated to each the genomic region are returned   
annotationAsRange：逻辑，如果属实，只有第一个和最后一个注解关联到每个区域的基因组的功能恢复

getJustFeaturesNumber: Logical, if TRUE only the numbers of annotation features overlapping the genomic regions are returned. If TRUE, only the first element specified with AnnotationsHeaders parameter is considered.      
getJustFeaturesNumber：逻辑，如果属实，只重叠的基因组区域的注解功能的数字返回。如果是TRUE，只AnnotationsHeaders参数指定的第一个元素。


Details

详情----------Details----------

The annotation features overlapping the input genomic regions are used to add optional annotations field to the GenomicRegions object.
输入基因组区域重叠的批注功能是用来添加可选的注释字段的GenomicRegions对象。

If previous optional annotations fields are present, they are preserved as well in the output object
如果以前可选的注释字段，他们目前被保存在输出对象以及


值----------Value----------

A GenomicRegions object with optionalAnnotations
一个optionalAnnotations GenomicRegions对象

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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