eset2GenomicAnnotations(PREDA)
eset2GenomicAnnotations()所属R语言包:PREDA
Function building a GenomicAnnotations object on an ExpressionSet object
建设上ExpressionSet对象1 GenomicAnnotations对象的功能
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function building a GenomicAnnotations object on an ExpressionSet object
建设上ExpressionSet对象1 GenomicAnnotations对象的功能
用法----------Usage----------
# eset2GenomicAnnotations(.Object, retain.chrs,
# optionalAnnotations)
eset2GenomicAnnotations(.Object, ...)
参数----------Arguments----------
参数:.Object
ExpressionSet object. The associated annotation library will be used to build a GenomicAnnotations object.
ExpressionSet对象。相关注释库将用于,建立GenomicAnnotations对象。
参数:...
See below
见下文
retain.chrs: Numeric vector, containing the list of chromosomes selected for the output GenomicAnnotations object. E.g. set retain.chrs=1:22 to limit the GenomicAnnotations object to chromosomes from 1 to 22. This might be ueseful to limit GenomiAnnotations objects to autosomic chromosomes.
retain.chrs:数字向量,其中包含列表为输出GenomicAnnotations对象选择的染色体。例如设置retain.chrs = 1时22分,以限制GenomicAnnotations对象从1到22条染色体。这限制GenomiAnnotations的对象autosomic染色体可能是ueseful。
optionalAnnotations: Character vector to select additional annotations fields to be included into the GenomicAnnotations object.
optionalAnnotations:选择额外的注释字段到GenomicAnnotations对象的特征向量。
值----------Value----------
An object of class "GenomicAnnotations"
一个对象的类"GenomicAnnotations"
作者(S)----------Author(s)----------
Francesco Ferrari
参见----------See Also----------
"GenomicAnnotations"
"GenomicAnnotations"
举例----------Examples----------
## Not run: [#无法运行:]
require("PREDAsampledata")
data(gaExpressionSetRCC)
GEGenomicAnnotations<-eset2GenomicAnnotations(gaExpressionSetRCC,
retain.chrs=1:22)
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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