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R语言 prada包 threePanelPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 11:20:37 | 显示全部楼层 |阅读模式
threePanelPlot(prada)
threePanelPlot()所属R语言包:prada

                                        Visualize cytometry data
                                         流式单元仪的数据可视化

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to visualize multivariate (cytometry) data in three two-dimensional plots.
在两三个立体图的功能,可视化多元(流式单元仪)的数据。


用法----------Usage----------


threePanelPlot(data, x.panels = c(1, 4, 5), y.panels = c(2, 3, 6),
               tot.width = 15, tot.height = 5.4, maxcells = 20000,
               limits = c(0, 1023), remove.extremes = TRUE,
               plotTitle = "Three-Panel Plot", use.smoothScatter = TRUE,
               palette = colorRampPalette(brewer.pal(9, "Blues")),
               new.device = TRUE, verbose = TRUE,
               addPoints = NULL, addCol = "red", ...)



参数----------Arguments----------

参数:data
data matrix to visualize
矩阵数据的可视化


参数:x.panels
which variables (columns) are to be plotted at the x-axis of the three variables
要在三个变量x轴绘制哪些变量(列)


参数:y.panels
which variables (columns) are to be plotted at the y-axis of the three variables
要在三个变量Y轴绘制哪些变量(列)


参数:tot.width
width of a new device to open, see argument new.device
打开一个新的设备的宽度,参数new.device


参数:tot.height
height of a new device to open, see argument new.device
打开一个新的设备的高度,看到参数new.device


参数:maxcells
maximum number of observations (cells) for plotting; higher numbers reduce performance
观测的最大数量(单元)的图;较高的数字降低性能


参数:limits
minimum and maximum value (theoretically) observed in the data; e.g., with 10-channel digitized data it is c(0,1023)
观察数据的最低和最高值(理论上),例如10通道数字化数据,它是C(0,1023)


参数:remove.extremes
logical; are extreme values (equal to theoretical limits) to be removed before plotting
逻辑;极端值(等于理论limits)被删除之前绘制


参数:plotTitle
title for the plot
图标题


参数:use.smoothScatter
logical, should the function smoothScatter be employed for plotting the data (plots data densities rather than individual points)
逻辑,应该的功能smoothScatter绘制的数据(图数据密度,而不是个别点)聘用


参数:palette
if smoothScatter is used, which colour palette is it to use
如果smoothScatter,调色板,它是使用


参数:new.device
logical; should a new device be opened for the three plots; if FALSE the three plots will be plotted to the currently active device
逻辑;应该打开一个新的设备,三幅图;如果FALSE三个图将被绘制到目前的有源器件


参数:verbose
logical; do you want extended output to STDOUT
逻辑;你想扩展输出到STDOUT


参数:addPoints
should special points be marked after plotting the data; is expected to be a subser of argument data with the same number of columns (=variables); if NULL no points are marked
特殊点应标明绘制的数据后,有望成为一个参数subserdata相同数量的列(变量);如果NULL没有点标


参数:addCol
in which colour are the points in addPoints to be marked
在颜色addPoints被标记的点


参数:...
further arguments passed on to plot.default
通过进一步的论据plot.default


值----------Value----------

no value is returned; the function is called to produce three plots
没有返回值的功能,被称为三个图


作者(S)----------Author(s)----------


Joern Toedling <a href="mailto:toedling@ebi.ac.uk">toedling@ebi.ac.uk</a>



参见----------See Also----------

plot.default
plot.default


举例----------Examples----------


   # generate some data:[产生的一些数据:]
   toyData <- cbind(matrix(pmax(0,pmin(runif(3000)+rnorm(3000),4)),ncol=3),
                    matrix(pmax(0,pmin(rnorm(3000,2,1),4)),ncol=3))
   colnames(toyData) <- paste("Var",1:6,sep="")
   toyQuantiles <- apply(toyData,2,quantile,probs=c(0.25,0.5,0.75))

   # plot it and mark the quantiles:[绘制和纪念位数:]
   threePanelPlot(toyData,addPoints=toyQuantiles,
                  addCol=c("orange","red","purple"),limits=c(0,4),pch=20)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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