R语言 prada包 gateSet-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

gateSet-class(prada)
gateSet-class()所属R语言包：prada

                                        'gateSet': a class for subsetting flow-cytometry data by defining
                                         “闸的造价”：一类流式单元仪数据子集定义

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

In flow-cytometry analysis, regions in two-dimensional projections of the data space often have to be selected. Objects of
在流式单元仪分析，在两维数据空间预测的区域经常有被选中。对象


创建对象----------Creating Objects----------

Objects can be created using methods of the generic function  drawGate or via<br>   new("gateSet",<br>     glist = ....,   # object of class list<br>   )<br>
对象可以创建使用泛型函数的drawGate或通过参考  new("gateSet",参考    glist = ....,   # object of class list参考  )参考方法


插槽----------Slots----------




name: Object of class character giving the name of the object. You can reference the object by its name for subsequent
name：Object类的character对象的名称。你可以通过其名称引用对象为后续




glist: Object of class "list" with items of class gate. The individual gate objects will be combined according to
glist：类项目类"list"gate对象。个人gate对象将根据合并


方法----------Methods----------




applyGate: applyGate(x, data) applies the gating of object x on data objects of class
applyGate：applyGate(x, data)适用对象门x类的数据对象




length length of slot glist
线长度插槽glist




show display summary
显示display summary




names, names<- extract or replace the names of the individual gate
姓名，名称< - 提取或替换个别gate名




[ subset to gateSet
[子集gateSet




[[ subset to individual gate
[子集个人gate




appendGates append a gate or gateSet to a
appendGates追加gate或到gateSet


作者（S）----------Author(s)----------


Florian Hahne



参见----------See Also----------

cytoFrame, gate
cytoFrame，gate


举例----------Examples----------


sampdat <- readFCS(system.file("extdata", "fas-Bcl2-plate323-04-04.A01",
                               package="prada"))
g1 <- new("gate", name="G1", gateFun=function(x)x[,"FSC-H"]<500, logic="&amp;",
          colnames="FSC-H")
g2 <- new("gate", name="G2", gateFun=function(x)x[,"SSC-H"]>800, logic="&amp;",
          colnames="SSC-H")
g3 <- new("gate", name="G3", gateFun=function(x)x[,"FL1-H"]>800, logic="&amp;",
          colnames="FL1-H")
gs <- new("gateSet", name="Set1", glist=list(G1=g1, G2=g2))
length(gs)
gs[[1]]
gs[1]
gsnames <- names(gs)
names(gs) <- gsnames
applyGate(sampdat, gs)
applyGate(exprs(sampdat), gs)
gate(sampdat) <- gs
applyGate(sampdat, 1)
applyGate(sampdat, "G1")
applyGate(sampdat, TRUE)
appendGates(sampdat, g3)


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。