R语言 ppiStats包 inOutScatterCharts()函数中文帮助文档(中英文对照)

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inOutScatterCharts(ppiStats)
inOutScatterCharts()所属R语言包：ppiStats

                                        A function to create scatter plots of the in-degree and out-degree
                                         一个函数来创建的入度和出度的散点图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes a list of directed graph objects and plots the out-degree against the in-degree for each vertex. A binomial test is used to determine         if there is a highly disproportionate in-degree or out-degree given a p-value  threshold (the binomial test presumes p = 0.5).  
这个函数接受一个有向图的对象和图，对每个顶点的入度出度的列表。使用二项式测试，以确定是否有p值阈值（二项分布测试假定P = 0.5），在度或出度的高度不成比例。


用法----------Usage----------


inOutScatterCharts(dataGraphs, pThresh=0.01, pLevels=1e-4)



参数----------Arguments----------

参数：dataGraphs
A named list of directed graphNELs
名为的指示graphNELs的列表


参数：pThresh
The two-sided p-value threshold for the binomial testing for potentially biased nodes
双面p值的阈值的潜在偏见的节点二项式测试


参数：pLevels
Figure out what this does
弄清楚这是什么做的


值----------Value----------

For each directed data graph, this function generates 3 pdf scatter-plots and 1 eps  scatter plot. The pdf files are: 1. A scatter plot of each nodes out- vs in-degree where points outside the staircase bundaries are those rejected in the binomial test. 2. A scatter plot of each nodes out- vs in-degree scaled by sqrt where points outside  the conic region are those rejected in the binomial test.     3. A histogram for the distribution of p-values for each node
此功能为每个执导的数据图，生成PDF分散图和1 EPS散点图。 PDF文件是：1。散点图的每个节点，比度点的楼梯bundaries外是那些拒绝在二项式测试。 2。散点图的每个节点，与学位缩放SQRT锥区域以外的地方是那些拒绝在二项式测试。 3。每个节点p值分布直方图

The eps file contains the same information as the second pdf file.            
EPS文件中包含的第二PDF文件相同的信息。


作者（S）----------Author(s)----------


T Chiang



举例----------Examples----------


graphs = lapply(bpExperimentNames, function(x) get(x))
names(graphs) = bpExperimentNames
#inOutScatterCharts(graphs)[inOutScatterCharts（图）]

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