idProteinErrorType(ppiStats)
idProteinErrorType()所属R语言包:ppiStats
A function to identify those proteins affected by either
一个确定通过以下方式影响这些蛋白质的功能
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function takes in either a bait to prey Graph (matrix) and, based on a binomial error model, partitions proteins identified as either affected by systematic or stochastic error. It is a wrapper function that will eventually call the qbinom function.
此功能需要猎物图(矩阵),并根据二项式误差模型,通过系统或随机误差的影响,确定分区蛋白质在任何一个诱饵。这是一个包装函数,将最终调用qbinom的功能。
用法----------Usage----------
idSystematic(bpMat, viable, bpGraph = FALSE, pThresh = 0.01, pLevels =
1e-4, prob=0.5)
idStochastic(bpMat, bpGraph = FALSE, pThresh = 0.01, pLevels =
1e-4, prob=0.5)
参数----------Arguments----------
参数:bpMat
Either a bait to prey directed graphNEL or its corresponding adjacency matrix.
无论是猎物的诱饵定向graphNEL或其相应的邻接矩阵。
参数:viable
This is a character vector of viable proteins. It is only used in the idSystematic function.
这是一个可行的蛋白质的特征向量。它仅用于在idSystematic功能。
参数:bpGraph
A logical. If TRUE, than bpMat is passed in by the user as a graphNEL.
一个逻辑。如果是TRUE,比bpMat是通过在作为graphNEL的用户。
参数:pThresh
The p-value threshold for which to partition stochastic or systematic errors
p值阈值分区随机或系统误差
参数:pLevels
A numeric. It gives the levels to calculate the countours of the function in p in the (n-in, n-out)-plane
一个数字。它给人的水平计算在P(N,N-出)平面功能countours的
参数:prob
A numeric. The probability parameter in the call to the qbinom function.
一个数字。到调用的qbinom功能中的概率参数。
值----------Value----------
A character vector of proteins either affected by systematic or stochastic errors.
一种蛋白质的特征向量系统或随机错误的影响。
作者(S)----------Author(s)----------
T Chiang
参考文献----------References----------
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|