R语言 ppiStats包 genBPGraph()函数中文帮助文档(中英文对照)

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genBPGraph(ppiStats)
genBPGraph()所属R语言包：ppiStats

                                        A function to generate the protein-protein interaction (ppi)
                                         一个函数来生成蛋白质相互作用（PPI）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function will take the ppi data and generate instance of the  class graph.
此功能将采取PPI数据，并生成类图的实例。


用法----------Usage----------


genBPGraph(bpMat, directed=TRUE, bp=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：bpMat
An adjacency matrix of PPI. If the matrix is obtained by empirical data, or bait to prey, then the   rows are indexed by the baits and the columns indexed by the  preys. If the rownames are not the same as the column names (i.e. a generic bait to prey matrix) the argument bp must be set to TRUE.
PPI的邻接矩阵。如果矩阵获得的经验数据，或诱饵，猎物，然后行的猎物的诱饵和索引中的列索引。如果的rownames是不相同的列名（即一个通用的诱饵，猎物矩阵）的说法，BP必须设置为TRUE。


参数：directed
A logical - if TRUE, the object will be a directed graph rather than an ordinary graph. For bait to prey interactions, this  parameter must always be set to TRUE.
逻辑 - 如果为true，该对象将是有向图，而不是一个普通的图形。为诱饵，猎物的相互作用，这个参数必须总是被设置为TRUE。


参数：bp
A logical - if TRUE, it signifies that the adjacency matrix  is a bait to prey empirically derived matrix so that the bait population (rownames) is usually different from the prey population (colnames).
逻辑 - 如果属实，这标志着邻接矩阵是一个猎物经验得出的矩阵，以便的诱饵人口（rownames）通常是由不同的猎物人口（colnames）的诱饵。


值----------Value----------

An instance of the class graph.
类图的一个实例。


作者（S）----------Author(s)----------


T Chiang



举例----------Examples----------


library(ppiData)
library(graph)
data(y2hSysGW)
eg=y2hSysGW[[3]]
egMat = bpMatrix(eg)
genBPGraph(egMat)

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