R语言 plw包 scaleParameterPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

scaleParameterPlot(plw)
scaleParameterPlot()所属R语言包：plw

                                        Scale parameter plotted against mean intensity
                                         尺度参数暗算平均强度

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Will produce a scatter plot of variance estimators (logged) for each probe (probe set) against the corresponding mean intensity together with the fitted scale-parameter curve and points showing the knots of the used spline.
将产生的方差估计为每对相应的平均强度与规模的拟合参数曲线和展示用样条上的结点的探针（探针组）（记录）的散点图。


用法----------Usage----------


scaleParameterPlot(model,main="Scale parameter curve",
           col=1,pch='.',lty=1,curveCol=2,knotsPch=19,knotsCol=3)



参数----------Arguments----------

参数：model
On object obtained from the function plw or lmw.
功能的PLW或LMW从获得的对象。


参数：main
Main title of plot.
主称号图。


参数：col
Color for individual points (mean,logs2).
个别点的颜色（，logs2）。


参数：pch
Plot symbol for individual points (mean,logs2).
图符号，个别点（，logs2）。


参数：lty
Line type for fitted scale parameter curve.
装尺度参数曲线的线路类型。


参数：curveCol
Line color for fitted scale parameter curve.
尺度参数的拟合曲线的线条颜色。


参数：knotsPch
Plot symbol for spline knots.
样条结积符号。


参数：knotsCol
Plot color for spline knots.
样条海里的图色彩。


作者（S）----------Author(s)----------


Magnus <i>A</i>strand



参见----------See Also----------

plw, lmw
PLW，LMW


举例----------Examples----------



# ------------------------------------------[------------------------------------------]
# Example using the result of the analysis of[例如，使用的分析结果]
# the 6 arrays in the AffySpikeU95Subset data set[6阵列在AffySpikeU95Subset数据集]

# Loading the data[加载数据]
data(AffySpikeU95Subset)

# Defining design and contrast matrix[定义设计和对比矩阵]
group<-factor(rep(1:2,each=3))
design<-model.matrix(~group-1)
contrast<-matrix(c(1,-1),1,2)

# Analyzing using plw[分析使用PLW]
model1<-plw(AffySpikeU95Subset,design=design,contrast=contrast,
            epsilon=0.01)

## Look at fitted curve for scale parameter[＃看看尺度参数的拟合曲线]
scaleParameterPlot(model1)


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