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R语言 plgem包 LPSeset()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 11:13:31 | 显示全部楼层 |阅读模式
LPSeset(plgem)
LPSeset()所属R语言包:plgem

                                         ExpressionSet for Testing PLGEM
                                         为测试PLGEM ExpressionSet

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This ExpressionSet object contains a subset of the microarray data used in References for PLGEM set-up and validation. Briefly, it contains normalized gene expression values from a total of 6 hybridizations on MG-U74Av2 Affymetrix GeneChip microarrays. Two experimental conditions are represented in this dataset: the baseline condition ("C") contains data of immature murine dendritic cells (4 replicates); the other condition ("LPS") contains data of the same cells stimulated for 4 hours with LPS (2 replicates).
这ExpressionSet对象包含在为PLGEM设置和验证的参考使用的芯片数据的一个子集。简言之,它包含了归一共有6对MG-U74Av2 Affymetrix基因芯片杂交的基因表达值。两个实验条件在这个数据集表示:基线条件(“C”)包含未成熟小鼠树突状单元的数据(复制),包含4小时刺激的相同单元中的数据的其他条件(脂多糖) LPS(复制)。


用法----------Usage----------


  data(LPSeset)



格式----------Format----------

An object of class ExpressionSet.
对象类ExpressionSet。


作者(S)----------Author(s)----------



Mattia Pelizzola <a href="mailto:mattia.pelizzola@gmail.com">mattia.pelizzola@gmail.com</a>

Norman Pavelka <a href="mailto:normanpavelka@gmail.com">normanpavelka@gmail.com</a>




参考文献----------References----------

Ricciardi-Castagnoli P. A power law global error model for the identification of differentially expressed genes in microarray data. BMC Bioinformatics. 2004 Dec 17;5:203.; http://www.biomedcentral.com/1471-2105/5/203

举例----------Examples----------


  data(LPSeset)
  head(exprs(LPSeset))

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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