R语言 plateCore包 xyplot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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xyplot(plateCore)
xyplot()所属R语言包：plateCore

                                         Scatter plots (dotplots) for flowPlates.
                                         散点图（dotplots）flowPlates的。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A function to create dotplots, and smoothed scatter plots, from flowPlates. This function is a slightly modified version of xyplot from flowViz.  The flowPlate xyplot allows users to  overlay plots of test samples versus controls, and makes creating informative flowStrips easier. Refer to the documentation for xyplot from flowViz and lattice for more detailed information.
函数创建dotplots，平滑散点图，来自flowPlates。此功能是略加修改的xyplot从flowViz版本。 flowPlate xyplot允许用户覆盖测试样品与控制图，并使创建翔实flowStrips容易。更详细的信息，请参阅文件为xyplot从flowViz的和晶格。


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'formula,flowPlate'
xyplot(x, data, xlab, ylab,
                                as.table = TRUE,
                                prepanel = prepanel.xyplot.flowPlate,
                                panel = panel.xyplot.flowPlate,
                                pch = ".", smooth = TRUE,
                                filter = NULL,
                                filterResults = NULL,
                                displayFilter = TRUE,
                                flowStrip=NULL,
                                flowStripCex=1,
                                strip=function(...,style=1) strip.default(...,style=1),
                                ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
A formula describing the layout of the plots. Plots for flowPlates usually condition on either as.factor(name) or as.factor(Well.Id) since only one flowFrame can be shown on each panel (with the exception of Negative.Control overlays).
一个公式描述的图的布局。为图flowPlates通常条件或者as.factor(name)或as.factor(Well.Id)因为只有一个flowFrame可以在每个面板（异常Negative.Control覆盖）所示。


参数：data
A flowPlate.
一个flowPlate。


参数：xlab
Label for x-axis.
X轴的标签。


参数：ylab
Label for y-axis.
为y轴的标签。


参数：as.table
Defaults to table layout.
默认表布局。


参数：prepanel
Lattice-flowViz prepanel function.
的格子flowViz prepanel功能。


参数：panel
Lattice-flowViz panel function.
格flowViz面板功能。


参数：pch
Plotting character.
绘制字符。


参数：smooth
Plot a smoothed scatterplot by default.
默认情况下，画出一个平滑散点图。


参数：filter
A flowCore filter to apply to each flowFrame.
一个flowCore过滤器适用于每个flowFrame。


参数：filterResults
If filterResults="Negative.Control", the negative control wells corresponding to a test well are overlayed in the test well plots.
如果filterResults =“Negative.Control”，相应的测试阴性对照井井叠加在试验井图。


参数：displayFilter
Defaults to displaying filter on the plot.
默认显示过滤器上的图。


参数：flowStrip
Character vector indicating additional information to be printed on the strip. Values can include any combination of "Well.Id","MFI","MFI.Ratio", and "Percent.Positive".
特征向量表示更多的信息，要带印。值可以包含任何组合“Well.Id”，“小额信贷机构”，“MFI.Ratio”，和“Percent.Positive的”。


参数：flowStripCex
Font size for the flowStrip.
字体大小为flowStrip。


参数：strip
Lattice strip function.
莱迪思带功能。


参数：...
Optional arguments
可选参数


作者（S）----------Author(s)----------


Errol Strain



参见----------See Also----------

flowViz::xyplot
flowViz::xyplot


举例----------Examples----------


library(plateCore)
data(plateCore)

# Create a flowPlate from the sample data in plateCore[从在plateCore的样本数据，创建1 flowPlate]
fp <- flowPlate(pbmcPlate,wellAnnotation,plateName="P1")

## Create a rectangle filter[＃创建一个矩形过滤器]
rectGate <- rectangleGate("FSC-H"=c(300,700),"SSC-H"=c(50,400))

xyplot(`SSC-H` ~ `FSC-H` | as.factor(name),
        fp[1], smooth=FALSE, filter=rectGate, displayFilter=FALSE)

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